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PulseDIA定量蛋白质组学

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参考报价: 2200-5200 RMB(人民币) 型号: /
品牌: 西湖欧米 产地: 中国
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技术介绍:

PulseDIA技术是西湖欧米的专利技术,在传统的DIA 技术的基础上,将一个窗口根据质荷比分割成更小范围的多个窗口,并将这些窗口以脉冲的方式均匀分配至不同的质谱方法进行采集。同一个样本分成多次短梯度进样,每次进样方法均有不同的质谱窗口,最后合并分析几次采集的质谱数据,达到更高的多肽和蛋白质鉴定量。

PulseDIA-1.png

技术优势:

1. 西湖欧米专利技术,在常规DIA的基础上提升蛋白鉴定数量10%-30%;

2. 结合PCT样本前处理技术,可以实现临床微量样本(如FFPE、穿刺活检、泪液等)的高深度蛋白质定量分析,组织样本最低送样量只需0.1mg。

 

项目案例:

Mol Cell Proteomics | 深度DIA蛋白质组学鉴定慢性髓系白血病获得性耐药的靶向调节因子

为了解K562细胞对甲磺酸伊马替尼(IMA)和阿霉素(ADR)耐药的潜在机制,用低剂量IMA或ADR处理K562细胞2个月,根据耐药指数的增加判断其对药物的轻、中、重度耐药。基于PulseDIA定量蛋白质组学技术从数据集中总共鉴定和量化了98232种肽的7082种蛋白质。发现Sirtuin信号通路在耐ADR和耐IMA的K562细胞中显著富集。特别是,IDH2被确定为与耐药表型相关的潜在药物靶标。

 PulseDIA-2.png

参考文献:

1.Cai, et al. PulseDIA: Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry Using Multi-Injection Pulsed Gas-Phase Fractionation. Journal of Proteome Research. 2021.20(1):279-288.

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.0c00381

2.Liu, et al. DIA-based Proteomics Identifies IDH2 as a Targetable Regulator of Acquired Drug Resistance in Chronic Myeloid Leukemia. Mol Cell Prot. available at bioRxiv, 2021.

https://www.mcponline.org/article/S1535-9476(21)00159-6/fulltext#secsectitle0030


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