ü 基于质谱的 case/control 样品成对初步鉴定
ü 成对样品的Somatic SNV/InDel/CNV检测、注释及统计
ü 成对样品SNV/InDel的COSMIC 数据库注释分析
ü 成对样品SNV的保守型预测
ü 成对样品SV检测分析(CREST)及注释
ü 影响氨基酸改变的突变基因的 CancerGeneCensus 数据库注释分析
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ü 样本设计以及power计算
ü 群体SNP 检测和Genotype 分型检测
ü SNP注释与统计
ü 群体SNP 质控
ü 基于遗传数据的样本质控
ü 基于单个SNP的关联分析
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ü 群体 SNP 检测和Genotype分型检测
ü SNP注释与统计
ü 群体SNP质控
ü 基于遗传数据的样本质控
ü 基于参考单体型集合的基因型推断和单体型定相
ü 群体结构分析
ü 选择分析
ü 对受选择基因进行GO功能分类,以及GO/KEGG/PANTHER通路分析
ü 单体型分析
ü 染色体chrY和chrM单体型组分析
ü 群体迁移历史推断
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