全基因组酶切图谱(Optical mapping,简称OM)是基于限制性内切酶图谱的一项技术:通过微纳米加工技术将DNA单分子线性地固定在芯片上,使用限制性内切酶切割后再利用荧光标记所有的片段,zei后根据荧光的强度和位置定义DNA片段的长度和位置。每个DNA分子都具有独特的酶切片段长度组合,利用这些DNA分子之间的重叠关系组装成基因图谱,利用这种图谱定位scaffold的位置关系并进行比较基因组分析。OM可以快速定位序列位置,已广泛应用于比较基因组学分析发现突变基因、辅助高通量测序的数据组装以及菌株分型。
技术优势
- 组装的重要补充手段:酶切图谱属于物理图谱,不依赖于基因序列,是高通量测序后进行组装的重要补充手段;
- 准确性高:酶切图谱在物理水平上进行片段定位,定位准确,可信度高。
研究内容
一、动植物
- 酶切数据收集;
- 数据组装及分析;
- OM数据辅助延伸scaffold。
二、微生物
- 酶切结果;
- 数据组装及分析;
- OM图谱;
- Scaffold placement ;
- 比较基因组学分析;
- 菌株分型。
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全基因组酶切图谱价格
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