探究无限神奇的过去与未来
细菌基因组研究，是通过基因组测序和组装获得细菌全基因组序列，并对其进行结构和功能研究的方法。依据研究目标所需精细程度的不同，我们提供了细菌框架图、精细图和完成图三种不同的解决方案。通过对这些细菌测序研究，我们可以更好地了解和掌控菌株的生理过程，让细菌更好地为我们所用。
科学方案设计
从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。多平台的选择，不同精细程度的细菌基因组测序方案，适用不同研究背景，为您量身定制最适宜的细菌基因组解决方案。
| 产品 | 测序平台 | 测序策略 | 组装指标 | 适用范围 | 项目周期 |
| 细菌框架图 | Illumina PE150 | 350 bp文库 ≥ 100 X | 无 | 大规模测序 快速扫描 | 30个自然日 |
| 细菌精细图 | Illumina PE150 | 350 bp文库 ≥100X 6 Kbp文库 ≥100X | ≤30 scaffolds | 中等规模测序 适度精细 | 45个自然日 |
| 细菌完成图 | PacBio | 10 Kb SMRT 文库 ≥50 X | 1 contig 0 Gap | 少量菌株测序 精确到位 | 60个自然日 |
信息分析
分析内容=标准分析+高级分析。
不同精细程度的细菌基因组信息分析，解密细菌的发展历程，探究其潜在价值。
| 基因组组装 | 基因组组装及结果评估 | 组装获得高质量的基因组序列 |
| 基因组结构研究 | 编码/非编码基因预测 | 预测编码/非编码基因信息 |
| 重复序列分析 | 分析基因组重复序列结构 | |
| 基因岛预测 | 预测基因组内基因岛结构 | |
| 前噬菌体预测 | 预测基因组前噬菌体序列 | |
| CRISPR 预测 | 对基因组进行 CRISPR 预测 | |
| 基因基本功能注释 | 常见功能数据库注释 (NR、GO、COG、KEGG、SwissProt、Pfam、TCDB、CAZy) | 通过常见权威数据库解释编码基因功能 |
| 全基因组功能圈图展示（精细图/完成图） | 全面总览基因组组分情况 | |
| 基因组甲基化修饰分析（完成图） | 总览基因组甲基化修饰情况 | |
| 菌株致病相关研究 | 分泌系统效应蛋白、病原与宿主互作、分泌蛋白、次级代谢产物基因簇 | 从胞外分泌、宿主互作等机制解释菌株致病性 |
| 细菌致病菌毒力因子和耐药基因注释（VFDB、 ARDB、CARD ） | 毒力因子及致病性相关基因 |
深入到位的数据挖掘
不论是个体深入变异解析，还是群体进化历史解读，我们都有完备的解决方案，为您解决关心的生物学问题。
| 研究目标 | 应用技术 | 解决问题 |
| 个体深入变异解析 | 基因组间共线性分析 | 基因组一对一共线性比较寻找基因组间同源序列 |
| 基因组间变异检测 | 以共线性区域为基础全面解析基因组间变异信息 | |
| 群体进化历史解读 | Core-pan基因解析 | 构建Core-pan基因集合单拷贝基因用于进化分析 |
| 进化树构建、ANI、cgMLST | 构建菌株间进化关系解析菌株起源传播规律 |
悦读高质量测序数据，尽享HPC澎湃动力
细菌基因组测序采用先进的Illumina、PacBio测序平台，快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台（High Performance Computing，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合，实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展，高性能计算平台将会持续更新并扩容，以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
出色完成每一个项目环节
诺禾致源微生物客户遍布全球，截止2017年12月，已发表20余篇微生物文章，细菌基因组完成样品数超过20000个，项目合作领域涵盖了动植物致病菌、工业菌、益生菌、环境菌株等广泛领域。
“科学的方案设计，严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务”
确保每一个环节都能出色完成，助力科学研究。
细菌基因组测序价格
细菌基因组测序信息由北京诺禾致源科技股份有限公司为您提供，如您想了解更多关于细菌基因组测序报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。
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