表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表达的可遗传的变化的一门遗传学分支学科。主要包括ﾠDNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑和非编码ﾠRNAﾠ调控等。已有研究表明表观遗传与肿瘤、心血管、神经系统等疾病的发生发展都有非常密切的关系。博奥晶典科研服务提供针对DNAﾠ甲基化研究的完整解决方案。

博奥晶典ﾠDNAﾠ甲基化研究完整解决方案

• 芯片、质谱技术

Illumina 人 850K（EPIC）甲基化芯片、Sequenom质谱验证。

• 测序技术

全基因组甲基化测序、甲基化DNA免疫共沉淀测序(MeDIP-Seq)。        

DNAﾠ甲基化研究方向

EWASﾠﾠ研究实验设计

E W A S 研究策略

E W A S 研究策略

甲基化研究推荐产品Illumina 人 850K(EPIC) 甲基化芯片

2016年Illumina公司对450K甲基化芯片进行了升级，重磅推出了人 850K(EPIC) 甲基化芯片。

产品优势

1.超高性价比（成本约为WGBS的1/3）

2.支持发表文献多（约400篇）

3.DNA起始量低（250ng），兼容FFPE样本

4.全基因组覆盖，单碱基分辨率，可直接检测到发生甲基化的位点

5.可重复性高，技术重复的重现性>98%

产品参数

全基因组范围覆盖（ > 8 5 0 , 0 0 0 甲基化位点）

1.CpG sites outside of CpG islands

2.Non-CpG methylated sites identified in human stem cells (CHH sites)

3.Differentially methylated sites identified in tumor versus normal (multiple forms of cancer) and across several tissue types

4.FANTOM5 enhancers

5.ENCODE open chromatin and enhancers

6.DNase hypersensitivity sites

7.miRNA promoter regions

保留了> 9 0 % 450Kﾠ甲基化芯片的探针设计

DNA 甲基化研究应用案例

EWAS 研究案例：DNA 甲基化与精神分裂症的全基因组关联分析

研究背景

精神分裂症是一种常见的精神病，据世界卫生组织估计，全球精神分裂症的终生患病率大概为0.38%-0.84%。多起病于青壮年，表现为感知、思维、情感、意志行为等多方面障碍。发病原因复杂，多由遗传及环境风险因子共同致病。传统的遗传学研究识别了一些精神分裂症的候选基因，然而，外显率及比值比较低，以及可重复性较差，使得这些候选基因在精神分裂症发病机制中的角色受到限制。通过研究DNA甲基化与精神分裂症的发生之间的关系，可以更好的阐述疾病的发生发展的机制以及作为临床应用的分子标志物。

JAMA Psychiatry. 2016 May 1;73(5):506-14. 影响因子：14.417

研究路线

Biomarker研究案例：前列腺癌Biomarker研究

研究背景

前列腺癌是男性中最常见的恶性肿瘤之一，目前前列腺癌的传统诊断方法是检测血清中特异性抗原（PSA）浓度，对PSA偏高的患者进行穿刺活检最终确诊。然而，该方法的主要缺陷是PSA的特异性较差（PSA4-10ng/ml时，特异性只有25%-40%），其它如前列腺炎、前列腺增生等前列腺疾病也能引起PSA浓度的异常，所以会经常出现非必要的穿刺活检，给患者造成了极大的痛苦。因此，寻找一种灵敏度高、特异性强的早期前列腺癌诊断marker是十分迫切的。

研究路线

经典参考文献

1 . Montano C，et al. Association of DNA Methylation Differences With Schizophrenia in an Epigenome-Wide Association Study. JAMAPsychiatry. 2016 May 1;73(5):506-14.

2 . Wahl S，et al. Epigenome-wide association study of body mass index, and the adverse outcomes of adiposity. Nature. 2017 Jan 5; 541(7635):81-86.

3 . Zhao M，et al. IFI44L promoter methylation as a blood biomarker for systemic lupus erythematosus. Ann Rheum Dis. 2016 Nov; 75(11):1998-2006.

4 . Yao L, et al. 2015. Identification of specific DNA methylation sites on the Y-chromosome as biomarker in prostate cancer. Oncotarget.2015 Dec 1;6(38):40611-21.

5 .Rakyan V., et al . Epigenome-wide association studies for common human diseases.Nature Reviews Genetics,2011,12(8):529-41.

人DNA甲基化研究策略价格

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