微生物多样性测序（又称扩增子测序）是一种利用高通量测序技术对PCR所扩增的16S、18S、ITS等微生物物种特征序列的PCR产物进行检测的研究方法。 此类方法不需要对微生物进行分离纯化培养，尤其适用于环境微生物等样本的研究。

技术优势

不需纯化培养，高通量检测样本中微生物，可检测不可培养的微生物。

技术路线

技术参数

样本要求

土壤          10 g

粪便          3-5 g

血液          10 mL

污泥/沉积物   5-10 g

DNA           总量 ≥ 1 μg、浓度 ≥ 20 ng/μL

检测平台

测序平台：Illumina Hiseq

测序策略：PE250

测序深度：5万/8万reads

常规项目周期

实验检测：45个工作日（从收到客户预付款并收到样品之日起）

数据分析：15个工作日

应用方向

1、医学领域：常见疾病与人体微生物的关系研究；

2、动物领域：肠道、瘤胃（如产甲烷菌类群）与动物健康/营养消化研究等；

3、农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落研究等；

4、环境领域：雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境研究等；

5、特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究。

案例分析

巴西大西洋森林两个热带浅水湖泊淡水浮游细菌多样性的季节性

细菌在淡水环境中对有机和无机物质的循环是非常重要的。然而，对于热带系统中浮游细菌的多样性知之甚少。对热带湖泊碳和营养循环的研究表明，其与温带气候有很大差异的季节性。作者利用16S rRNA测序技术，研究了两个热带湖泊浮游细菌群落的季节变化，揭示了季节性和深度高度动态的浮游细菌群落，湖泊混合状态的差异与季节性β多样性有关。

参考文献

Avila M P, Staehr P A, Barbosa F A R, et al. Seasonality of freshwater bacterioplankton diversity in two tropical shallow lakes from the Brazilian Atlantic Forest[J]. FEMS microbiology ecology, 2017, 93(1).

微生物多样性测序价格

微生物多样性测序信息由上海百趣生物医学科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于微生物多样性测序报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。