比较转录组,是结合RNA-seq技术手段研究物种进化的技术手段。通过不同物种或亚种间mRNA序列差异分析近源物种间的亲缘关系,挖掘明显受到正向选择或负向选择的基因。是一种快速、全面解析不同品系、不同亚种进化关系及特定组织表达情况的生物学方法,能够从序列水平和基因表达水平发掘物种进化历程。适用于同一物种不同遗传背景品系(不同亚种、野生种、栽培种)的进化研究。已广泛应用于水稻、拟南芥、番茄等物种研究中。
送样要求
RNA总量:≥2ug
RNA浓度:≥100 ng/ul
RIN值:≥7.0
技术特色
GO多级分类注释分布饼图
KEGG注释统计
直系同源基因进化树
直系同源基因Ka/Ks分布图
Divergent和conserved 直系同源基因KEGG 注释通路图
SSR分布情况
1. Comparative transcriptome analysis reveals potential fruiting body formation mechanisms in Morchella importuna. AMB Express (IF=2.226), 2019.
2. Investigation of yellow horn (Xanthoceras sorbifolia Bunge) transcriptome in response to different abiotic stresses: a comparative RNA-Seq study. RSC Advances (IF=3.049),2020.
比较转录组测序价格
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