产品简介

宏基因组测序，是一种直接对某一特定环境中微生物基因组进行分析，通过构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体的多样性与丰度，是研究微生物功能多样性、开发新的生理活性物质等的一种新理念和新方法。对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用有着重要的理论和现实意义。

  产品优势：

  专业的研究方案：对测序结果组装分析后，得到微生物群体基因组及功能、分析微生物群体中物种和基因的多样性和丰度，微生物菌落结构与宿主（或环境）之间的相互关系等

  更合理的研究方法：在分析过程中，采用一些更为准确的方法，从而得到更为可靠的分析结果

  新的分析方法：增加了MGS等宏基因组分析的方法，对样品中的信息得到更大的解析

  技术路线：

内容分析        

     分析内容：

  样品要求：

  1.样品类型：环境样品 DNA；

  2.样品浓度：≥50 ng/ul；

  3.样品总量：≥15ug；单次文库制备用量为5ug，为保证实验的顺利进行，因此需保证样品总量大于3次以上的建库用量；

  4.样品纯度：OD260/280为1.8~2.2；

  5.电泳要求：主带清晰，无降解或轻度降解。

案例分析

案例分析：

  1、宏基因组揭示人体肠道微生物多样性

  本研究利用宏基因组，对27位健康哈扎人和11位意大利人进行肠道微生物分析。结果表明，哈扎人肠道微生物中与氨基酸代谢和多糖代谢相关基因丰度较高，意大利人肠道微生物中与单糖（葡萄糖、蔗糖、果糖等）代谢、氨基酸代谢有关基因丰度较高；两者之间的差异可能与其饮食有关。此外，哈扎人肠道微生物中抗生素耐药性基因组成与土壤、水体来源的抗生素耐药性组成相似，而意大利人的抗生素耐药性则跟其生活环境和抗生素使用范围类似。人体肠道微生物的研究有助于了解其在人体生理机能方面的作用，同时阐明了人类生活和生存方式的多样性。

肠道微生物抗生素耐药性分析

  2、宏基因组学研究揭示肠道菌群之间的生命运动规律

  本研究收集了181个来自于中国人肠道菌群的样本，其中98个中国肝硬化患者的粪便样品及83个健康中国人志愿者的粪便样品，验证阶段收集31个健康人及25个肝硬化患者的MGS丰度。从中获得269万个非冗余的人体肠道微生物菌群的基因集，建立了肝病肠道菌群基因集，其中36.1%的基因是发现的。共有75,245个基因在肝硬化患者和健康人志愿者中呈现显着差异，可以归类到66个基因簇，该基因簇为肝硬化的生物标记物，其中在肝硬化患者中富集的是28个基因簇，健康志愿者中富集的是38个基因簇。通过对粪便微生物中15个基因的检测可以诊断肝硬化，同时找到的细菌标志物为肝硬化微生态制剂的研发也提供了方向。

病人（n=123）和健康人（n=114）个体肠道菌群中富集的不同丰度的MGS

  参考文献：

  1. Metagenome Sequencing of the Hadza Hunter-Gatherer Gut Microbiota (Cell Press, 2015, IF = 9.571)

  2. Alterations of the human gut microbiome in liver cirrhosis. ( Nature, 2014, IF = 41.456)

宏基因组测序价格

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