代谢组学是继基因组学、蛋白组学之后又一热点学科，是系统生物学的重要组成部分，主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物（MW<1000）。其样品主要是尿液，血浆或血清，唾液，以及细胞和组织的提取液。主要技术手段是核磁共振（NMR ），液-质联用（LC-MS），气-质联用（GC-MS），色谱（HPLC，GC）等。通过检测一系列样品的谱图，再结合化学模式识别方法，可以判断出生物体的病理生理状态，基因的功能，药物的毒性和药效等，并有可能找出与之相关的生物标志物（biomarker）。
       液相质谱联用（LC-MS ）技术结合化学计量学很好地实现了对大量样品和微量代谢物的快速定性、定量分析，极大地推动了代谢组学的相关研究，成为研究代谢组学的主要手段之一。
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