Arraystar nrStar™ snoRNA PCR Array(H/M)是聚焦核仁小RNA(snoRNA)检测的PCR芯片。nrStar™ Human和Mouse snoRNA PCR芯片分别包含359个和370个权威数据库来源的snoRNA,覆盖了所有PCR技术可区分的核仁小RNA,是进行snoRNA表达检测与功能研究必不可少的工具。
产品列表产品名称 | 货号 | 规格 | 描述 |
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nrStar™ Human snoRNA PCR Array | AS-NR-003-1 | 384 well / plate | 359条snoRNA、7条snoRNA靶向snRNA以及4条snoRNP复合物成员mRNA |
nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480) | AS-NR-003-1-R | 384 well / plate |
产品特点
● 高覆盖范围—所有PCR技术可区分的snoRNA
● 高灵敏度—只需50ng总RNA,无需扩增
● 稳定有效的PCR引物—所有的snoRNA引物均在不同的细胞组织样本中通过严格验证
● 简单快速—只需将cDNA与SYBR® Green master mix混合,加入板中,然后运行qPCR,4小时之内就能得到实验结果
● 疾病分子标志物筛选—适用于疾病分子标志物的高通量筛选和验证
芯片设计背景
核仁小RNA (snoRNA)是一类中等长度的非编码小RNA,其长度60-400nt不等,与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs复合物发挥功能。在脊椎动物中,核仁小RNA的编码基因主要存在于蛋白编码基因的内含子区,经转录加工处理形成成熟的核仁小RNA分子。snoRNA参与多种生物学过程,比如rRNA的加工处理,RNA剪接和翻译,以及氧化应激反应的调控。snoRNA主要通过snoRNPs复合物来发挥作用。通过snoRNA碱基互补识别靶基因特定位点,snoRNPs复合物催化这些位点的2’-O甲基化或假尿嘧啶化反应。根据snoRNA结构与功能的不同,可以将snoRNA分为两大类:负责2’-O甲基化的box C/D snoRNA和负责假尿嘧啶化的box H/ACA snoRNA。另外,还存在一类比较特殊的snoRNA- scaRNAs (它们具有类似box C、box D或者box H、box ACA结构,特异表达于small Cajal body)。snoRNA可以产生更小片段的非编码RNA-sdRNA。sdRNA与miRNA类似,能够通过调节mRNA的稳定性来发挥作用。
多项研究表明,snoRNA在肿瘤中异常表达,并在肿瘤的转移过程中扮演着重要角色。在乳腺癌和前列腺癌中,SNORD50A发生了2个碱基的缺失突变,并且其拷贝数明显降低,因此被认为是抑癌基因。有趣的是,H/ACA box snoRNA SNORA42在肺癌中作为癌基因存在,抑制SNORA42的表达具有明显的抗癌作用。C/D box snoRNAs的表达水平常伴随肿瘤的发生而增加。有一些C/D box snoRNAs可以作为疾病的分子标志物,比如SNORD44和SNORD43与乳腺癌的不良预后相关。snoRNA在神经退行性疾病的发生发展过程也发挥着关键作用。snoRNAs在血液、痰液以及尿液中稳定存在,使其作为疾病分子诊断标志物方面具有巨大的前景。目前,snoRNA已经成为疾病领域特别是癌症领域里的研究热点。
nrStar™ Human snoRNA PCR芯片包括359条snoRNA、7条snoRNA靶向snRNA以及4条snoRNP复合物成员mRNA。此PCR芯片覆盖了所有PCR技术可区分的snoRNA,能够快速方便的检测出组织、细胞以及血液中的snoRNA的表达情况。它还可应用于疾病分子标志物的高通量筛选和验证。
为了确保数据质量,此芯片包含8个内参基因用于数据的均一化处理。此芯片还使用RNA Spike-in,PCC和GDC对照组来检测cDNA合成效率,PCR扩增效率和基因组DNA污染。