NSAM-08 比较基因组分析-系统发生分析

生物体的全基因组是由大量的基因以及非编码核酸组成的，所以，从理论上说，研究不同物种进化历史的最佳方法就是在全基因组水平上构建系统发生树。本方案在全基因组水平上，我们可以用不同的特征来考察物种之间的进化关系，能够从不同的观察角度和不同的层次（如序列层次和结构层次）来研究物种之间的系统发生关系。

• 基于多棵系统发生树的方法
• 基于基因内容的方法
• 基于基因次序的方法
• 基于连接的直向同源蛋白的方法
• 基于代谢途径的方法

de novo 基因组测序

基因组从头测序（de novo sequencing）是不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序，用生物信息学分析方法进行拼接、组装，从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术，可以获得动物、植物、细菌、真菌的全基因组序列，从而推进该物种的研究，为后续研究物种起源进化及特定环境适应性奠定基础。为该物种的后基因组学研究搭建一个高效的平台；为后续的基因挖掘、功能验证提供DNA序列信息。BioGenius利用新一代高通量测序技术(NGS)，并可联同单分子测序平台(Bionano)高效地完成所有物种的基因组序列图谱。