基于Chip-chip和Chip-Seq技术，本方案可以针对不同细胞类型中基因的启动子，增强子（Enhancers）和抑制子(Insulators）进行定位；针对不同细胞类型的增强子，抑制子和启动子上不同组蛋白修饰状态进行大规模全基因组分析，比较不同细胞类型下共性和特异性的组蛋白修饰；比较增强子和抑制子上组蛋白修饰状态的共性和特异性；同时，根据增强子组蛋白修饰状态特征预测新增强子，对新预测的增强子分析他们与对应基因活性之间的关联。根据以往的研究证实：组织或细胞类型特异表达的基因具有显著较多增强子信号特征，而细胞非特异性表达基因和特异性非表达基因不具有明显的增强子信号特征。

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