技术服务详细描述ChIP-seq测序/circRNA测序/转录组测序ChIP-seq测序ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的基因组DNA片段，并通过高通量测序，在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点
ChIP-seq测序/circRNA测序/转录组测序
ChIP-seq测序
ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的基因组DNA片段，并通过高通量测序，在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点，且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。
ChIP-seq优势：
用于在全基因组范围中研究蛋白特异结合的DNA片段，组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术，研究这三个主题有助于洞悉蛋白对基因表达的调控以及染色体的功能结构。具有“覆盖全，周期快，分析科学”的优势，已广泛应用于人、小鼠、酵母、水稻、拟南芥等物种的研究。
ChIP-seq操作步骤：
1、研究对象的选取；
2、提取DNA样本，DNA量≥20ng;
3、ChIP-seq文库构建；
4、PE150测序（10-20Mb）;
5、信息分析，通过对IP下来的合格DNA样本，建库测序，获得高质量reads，根据SCC曲线判断IP效果，通过motif分析判断IP的特异性以及分析的可信性，高效预测相关基因，进行功能富集分析、预测特异蛋白的功能，组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰。
服务周期：
50天
案例分析
案例：雌***受体结合异常与乳腺癌临床试验的相关性研究
雌***受体（ER）可与相关基因结合形成复合体并移位到细胞核结合下游基因激活它们转录，为肿瘤生长助力。在许多乳腺患者体内，就是因为该受体影响了基因的功能，从而引发致癌连锁反应。现在常用的***等乳腺癌治疗药物，就是通过阻断雌***受体对基因的作用而发挥效果。但在不少患者身上，这种药物的效果并不理想。本研究基于高通量平台的染色质免疫共沉淀技术ChIP-seq全基因组范围内寻找ER结合位点，从而鉴定雌***结合模式是否在患者肿瘤中存在差异。
circRNA测序
环状 RNA（circRNA）是一类特殊的 RNA 分子，也是 RNA 领域的研究热点。与传统的线性 RNA（linear RNA，含 5’和 3’末端）不同，circRNA 分子呈封闭环状结构，不受 RNA 外切酶影响，表达更稳定，不易降解。近几年的研究表明，circRNA 在生物的生长发育、疾病的发生发展、对外界环境的抵御等方面具有重要的调控作用。由于 circRNA 的闭合环状特性，通过去除 total RNA 中的 rRNA 和线性 RNA 分子，可以特异地富集 circRNA 分子后测序，更有针对性地分析受检样本中特定的 circRNA 谱、circRNA 剪接模式、组间差异和分子功能等。
服务特色
推荐测序模式
转录组测序
转录组测序是基于HiSeq平台，对待特定组织或者细胞在某个时期转录出来的所有mRNA进行测序，即可研究已知基因，亦能发掘新基因，全面快速地获得mRNA序列和风度信息。
案例分析
案 例 通过RNAseq技术全面解析乳腺癌组织中的可变剪切形式
乳腺癌组织由特定形式的转录本发挥特殊功能，本研究应用RNAseq技术获得了三种典型乳腺癌组织TNBC、non-TNBC和HER2阳性乳腺癌的转录本信息。该研究发现了新可变剪切形式和可变剪切后的新转录本，进一步研究发现，乳腺癌组织与正常乳腺组织在转录本表达水平和启动子转移水平存在显著差异，并RT-PCR验证CDK4，LARP1 , ADD3和PHLPP2等转录本形式。该研究第一次系统研究了不同亚型乳腺癌组织转录本利用可变剪切形式和转录本特异表达的情况。
威斯腾生物服务项目
| 分子生物学检测 | 蛋白质与免疫学 | 动物实验 |
| 实时荧光定量PCR | 单克隆抗体制备 | 帕金森疾病模型 |
| 免疫共沉淀（Co-IP） | 多克隆抗体制备 | 抑郁症动物模型 |
| ELISA（酶联免疫吸附法）技术 | Western-blot 实验服务 | 脊髓损伤模型 |
| 生化指标检测 | 蛋白双向电泳实验服务 | 脑外损伤模型 |
| 双荧光素酶报告基因检测 | 原核蛋白表达纯化 | 骨神经损伤模型 |
| 染色质免疫共沉淀（ChIP） | 真核蛋白表达纯化 | 心肌缺血模型 |
| GST pull Down | ITRAQ定量蛋白质组学 | 心力衰竭模型 |
| SLAC蛋白组学 | 肺动脉高血压动物模型 | |
| 高血压模型 | ||
| 病毒包装 | 实验课题整体外包 | 粥样动脉硬化模型 |
| 过表达/干扰慢病毒包装纯化 | 整体课题外包 | 大脑中动脉阻塞模型 |
| 过表达/干扰腺病毒包装纯化 | 细胞整体实验外包 | 慢性之气管炎模型 |
| 逆转录病毒包装纯化 | 动物整体实验外包 | 过敏性哮喘模型 |
| 腺相关病毒包装纯化 | 肺炎大鼠模型 | |
| 肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
| 蛋白芯片 | 原代细胞培养 | 肝纤维化模型 |
| 细胞因子芯片 | 骨髓间充质干细胞培养 | 胆结石模型 |
| BioPlex悬浮芯片 | 脂肪干细胞培养 | 急性胰腺炎模型 |
| 生长因子芯片 | 心肌成纤维细胞培养 | 急性肾衰竭模型 |
| 炎症因子芯片 | 软骨细胞培养 | 体内血栓模型 |
| 血管生成因子芯片 | 血管内皮细胞培养 | 关节炎模型 |
| 凋亡因子芯片 | 神经元细胞培养 | I型和II型糖尿病模型 |
| 趋化因子芯片 | 内皮组细胞原代培养 | 裸鼠成瘤 |
| HuProt TM 20K人类蛋白组芯片 | 基因编辑动物 | |
| 电生理相关服务 | 动物整体实验服务 | |
| 膜片钳实验 | ||
| 细胞生物学检测 | 高通量测序 | 代谢组学 |
| 细胞原代培养 | mRNA测序 | 气相色谱GC/MS |
| MTT检测 | LncRNA测序 | 液相色谱LC/MS |
| 细胞凋亡检测 | 全基因组测序 | 核磁共震NMR |
| 细胞周期检测 | RNA-Seq测序 | |
| 细胞克隆形成实验 | 外显子测序 | 影像学相关实验 |
| Transwell细胞迁移/侵袭 | 16s扩增子测序 | Micro-CT |
| 流式分选 | Small RNA测序 | 小动物活体成像 |
| CCK8/XTT检测 | 宏基因组测序 | 核磁共振 |
| 台盼蓝检测细胞活性 | 单细胞测序 | PET-CT |
| 药物筛选细胞学实验 | circleRNA测序 | |
| 细胞粘附性检测 | 甲基化测序 | 基因编辑动物 |
| 细胞划痕实验 | 条件性敲除小鼠/大鼠 | |
| 细胞生物学整体实验 | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
| 细胞成管实验 | ||
| 病理检测 | CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
| 扫描电镜 | 基因定点突变细胞系 | LncRNA芯片 |
| 透射电镜 | 单基因敲除细胞系 | miRNA芯片 |
| HE染色 | 多基因敲除细胞系 | mRNA芯片 |
| 免疫组化 | 目的基因敲入细胞系 | 甲基化芯片（限人和小鼠来源样本） |
| Tunel（原位末端凋亡法）检测 | 报告基因敲入细胞系 | SNP芯片（限人和小鼠来源样本） |
| 激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除细胞系 | |
| 免疫荧光 | ||
| Masson染色 | CRISPR/Cas9动物敲除/敲入 | 科研设计指导&文章评估/润色 |
| 原位杂交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | 科研文献论著翻译 |
| 荧光原位杂交 | 基因敲入大鼠/小鼠 | 论文翻译润色服务 |
| 特殊染色（PSA、茜素红、阿尔新蓝等） | 临床实验/科研实验设计方案指导 | |
| 行为学检测 | 药物筛选服务项目 | 药效学评价 |
| 旷场实验 | 高通量自动药物筛选平台 | 抗肿瘤药物药效学评价 |
| 重复性刻板行为检测 | 细胞高内涵药物筛选平台 | 心血管系统药物药效学评价 |
| 动物跑台检测 | 蛋白质组学靶标研发平台 | 泌尿系统药物药效学评价 |
| 强迫游泳 | 分子药理研究平台 | 内分泌系统药物药效学评价 |
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