1. GSEA基因富集分析
对于各种高通量测序分析,会生成对每一个基因打分列表(第一列,基因名;第二列,表达量/Fold Change/其它打分)。利用新GSEA程序,对基因列表进行分析,检测差异基因是否富集到GO/KEGG/hallmark geneset。
图1 GSEA分析流程
2. WGCNA加权网络共表达分析
加权基因网络表达分析需要多个样品的数据,从而对基因在多样品中的表达规律进行总结,所以对样品数有一定的要求(>10)。 图2 多样品表达列表
3. 基因时序性分析(时序样品>=4)基因时序表达分析需要多个样品的数据,从而对基因在多样品中的表达规律进行总结,所以对样品数有一定的要求。采用Mfuzz对基因表达列表进行分析,检测多样品中显著出现的基因表达模式及这些表达模式所包含的基因。 图3 基因时序性分析实例结果4. 生信培训班晶锐生信培训班将定期举办,详细信息可关注公众号或联系相关区域销售!培训班主要课程除了紧扣新的研究热点和技术,也非常注重理论和实操相结合。
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