r 背景介绍
肝细胞癌(HCC)是一种高度异质性的疾病,预后预测具有挑战性。索拉非尼可诱导铁死亡,一种铁依赖性的受调节细胞死亡形式。然而,铁死亡相关基因在 HCC 中的预后价值仍有待进一步阐明。在本研究中,作者从公共数据库下载了 HCC 患者的 mRNA 表达谱和相应的临床数据。使用LASSO-Cox 回归模型在 TCGA 队列中构建多基因特征。来自 ICGC 队列的 HCC 患者用于验证。结果表明,在 TCGA 队列中,大多数铁死亡相关基因在 HCC 和相邻正常组织之间存在差异表达。在单变量 Cox 回归分析中,26 个差异表达基因 (DEG) 与总生存期 (OS) 相关。构建了一个 10 个基因的特征signature,将患者分为两个风险组。与低风险组患者相比,高风险组患者的 OS 显著降低。在多变量 Cox 回归分析中,风险评分是 OS 的独立预测因子。ROC曲线分析证实了该signiture的预测能力。r 数据来源 基因表达谱(TCGA数据库、ICGC数据库)r 分析流程r 参考文献Liang JY, Wang DS, Lin HC, Chen XX, Yang H, Zheng Y, Li YH. A Novel Ferroptosis-related Gene Signature for Overall Survival Prediction in Patients with Hepatocellular Carcinoma. Int J Biol Sci. 2020 Jul 6;16(13):2430-2441. doi: 10.7150/ijbs.45050. PMID: 32760210; PMCID: PMC7378635.
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