肿瘤SNPs统计分析

1 分析目的
统计分析肿瘤样本中的体细胞单核苷酸变异（SNPs）信息，对比肿瘤vs正常，挖掘肿瘤样本中的SNPs分布以及基因的突变频率
2 数据来源
UCSC Xena 数据库中的肿瘤体细胞突变数据集
3 分析方法
对下载数据区分SNPs和small INDELs，首先分析整体上不同类型SNPs的分布趋势（直方图），然后细分不同染色体的SNPs的分布，研究肿瘤的SNPs分布是否与某一特定染色体相关；挑选关键的部分基因，研究其突变频率的特点
4 交付文件
（1）所有样本SNP的信息、基因发生变异的频率信息（Excel）
（2）SNPs分布趋势图；基因突变频率分布图
5分析结果示例图