细菌基因组测序项目
罗宁生物细菌基因组测序是指利用二代及三代高通量测序技术,获得细菌的基因组序列,在全基因组组装的基础上进行基因组组分分析,功能注释,推测ORF编码蛋白序列,分析基因间相互作用、表达调控等功能。目前已成为研究细菌进化遗传机制,探究功能基因的重要工具。当前通过对细菌基因组测序可预测某些重要基因和蛋白,并了解起功能及作用机制,为后续深入研究提供基础。
根据不同的研究目的和测序要求,罗宁生物可为您提供四种类型的测序服务:细菌框架图、细菌精细图、细菌完成图和细菌重测序。
技术参数
分析内容 | 数据质控及统计 | 精细图组装分析 | 组装优化结果评价 | 基因预测 |
| 基因功能注释 | 重复序列预测 | ncRNA预测 | 致病性分析 |
| 共线性分析 | 基因家族分析 | 进化分析 | 定制化分析 |
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样本要求
1) 样品类型:基因组DNA;
2) 样品需求量:小片段文库≥0.5µg,2~3kb大片段文库≥20µg,5kb-6kb大片段文库≥25µg,10kb文库≥30µg,20 kb和40kb大片段文库≥60µg;
3) 样品浓度:小片段文库≥30ng/µl,大片段文库≥150ng/µl;
4) 样品纯度:OD260/280=1.8~2.0;
5) 样本运输:干冰或冰袋