结核分枝杆菌蛋白质组学

蛋白质鉴定

• 胶内蛋白质鉴定：鉴定实验组与对照组差异蛋白。
样本类型：凝胶电泳条带 → 样本处理 → 质谱检测 → 数据分析

• 溶液内蛋白质鉴定：鉴定靶标蛋白相互作用蛋白质。
样本类型：全细胞裂解液、IP 洗脱液、蛋白纯化产物…… → 样本处理 → 质谱检测 → 数据分析

定量蛋白质组学：应用于鉴定结核分枝杆菌在不同条件下蛋白质表达差异。

• 非标记定量：操作简便、试剂价格低。
样本处理：1. 蛋白提取 2. 蛋白酶解 3. 肽段脱盐  → 质谱检测 → 数据分析

• 标记定量：iTRAQ（可标记8 组样品）、和Dimethyl（3 组）标记。
样本处理：1. 蛋白提取 2. 蛋白酶解 3. 肽段标记 4. 样本混合 5. 液相分离  → 质谱检测 → 数据分析
 

蛋白质修饰组学：磷酸化、N- 糖基化、乙酰化、泛素化、甲基化、丙酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀酰化等。

• 基于SWATH 的定量蛋白质组学分析、基于PRM 的靶向蛋白质定量分析、基于定量蛋白质组学的互作分析
样本类型：1. 细胞样本 2. 组织样本 3. 血液样本 4. 分泌样本…… → 样本处理 → 质谱检测 → 数据分析