生物体内的基因系统调控是一个整体,单一组学看到的只是冰山一角,并不能完整的解释生物学问题,而且通常文章的影响因子也比较低。所以利用多组学技术将各组学的数据进行整合分析并深入挖掘生物学数据,可以对生物样本进行系统全面的研究。
糖基化蛋白质组学
目前,越来越多的研究者开始将微生物组学和代谢组学联合起来,肠道微生物菌群与宿主代谢表型的关系以及微生物群落如何影响代谢功能的研究是代谢组学与16S
rDNA测序整合分析非常典型的案例;此外,还有研究表明不同的疾病模型中微生物和代谢物之间具有很高的相关性,可通过代谢组学和16S
rDNA测序整合分析的方法研究代谢物-微生物-疾病之间的关系,有助于发现疾病的生物标记以更进一步应用于临床辅助诊断。
联合分析的优势
1.微生物与其生存的环境密切关联。微生物既会影响周围的环境,同时也会被环境影响。代谢物就是微生物与环境关联的重要桥梁。
2.微生物多样性研究越来越深入、研究范围也越来越广泛,单一的群落研究方法已经不能满足我们探究微生物的复杂作用机制的需求。
3.微生物和宿主的代谢物会影响彼此的生理状态,因此代谢组学和16S rDNA测序分析联合可以对微生物与代谢物的深入研究,有利于揭示复杂的微生物-环境、微生物-宿主之间的密切联系。
研究目的
高盐饮食是高血压的重要危险因素之一。 据报道,肠道菌群与高盐诱导的高血压(hSIH)有关。然而,肠道菌群在 hSIH 发病机制中的具体作用尚未完全阐明。文献主要探讨肠道菌群在 hSIH 发生发展中的作用及其机制。
研究方法
16Sr RNA基因测序+非靶向代谢组学
研究结果
本研究采用16S
rRNA 基因测序对高盐饮食组(HSD组,n=10)和对照组(n=10)的大鼠粪便进行测序,与对照组相比,HSD组大鼠的厚壁菌 /
拟杆菌比值明显增加,表明肠道出现了菌群失调。HSD
组有31个肠道属或种的丰度发生显著改变,其中22个明显降低。在这22种细菌中,有12种、8种和2种分别属于拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门。其余9种细菌的丰度明显增加,它们分别属于放线菌门、厚壁菌门和变形菌门。同时对HSD组和对照组的粪便样本进行非靶代谢检测,分别有955和641个峰值特征、峰值强度发生显著变化。这些代谢产物包括氨基酸衍生物、胆汁酸、脂类、脂肪酸、糖皮质激素和吲哚衍生物,其中许多是由肠道细菌直接产生或调节的。
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