SNP芯片/SNP检测/SNP分型

SNP芯片

SNP（Single Nucleotide Polymorphism），即单核苷酸多态性，是由于单个核苷酸改变（包括转换、颠换、缺失和插入）而导致的 DNA 序列多态性。SNP 检测已广泛应用于疾病易感基因鉴定、标记开发和基因定位、群体遗传学研究等多个领域中。

Illumina 的高通量 SNP 芯片是基于 Infinium 技术的全基因组 SNP 检测芯片（Infinium™ Whole Genome Genotyping），适用于全基因组 SNP 分型研究及基因拷贝数变化研究，一张芯片检测几十万标签 SNP 位点，提供大规模疾病基因扫描。

技术特点

独特的位点设计：采用 HAPMAP 数据库中已经公布的 TagSNP 设计，具有无可比拟的覆盖优势

芯片形式灵活多样：可同时检测 4、8 或 12 个样本，还可以增加定制位点

高通量密度：可检测高达 500 万的 SNP 位点

较高的成功率和准确性：

等位基因特异性延伸保证高质量的实验结果

定制灵活：任意物种、任意位点随意组合，除 SNP 外，还可以针对拷贝数变异（CNV）进行设计

SNP检测

单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNP）是指基因组上单个核苷酸的变异，人类基因组平均每1000个就有一个SNP。它是由基因组DNA某一特定核苷酸位置上单个碱基的转换、颠换、插入或缺失引起的点突变，使得群体之间和个体之间产生了差异。其中转换和颠换发生频率较高，转换是指同型碱基之间的转换，即嘌呤与嘌呤、嘧***与嘧***间；颠换是指发生在嘌呤与嘧***之间的替换。事实上转换的发生频率占多数，且CG序列上出现的SNP最为频繁，而且多是C转换为T，原因是CG中的C常因为甲基化自发地脱氨基后即成为T。

技术应用

SNP作为第三代遗传标记，在复杂疾病的基因定位、关联分析、个体疾病易感性分析与药物基因组学的研究中发辉了重要的作用。除医学研究外，SNP已逐渐涉及遗传学、生态学、作物育种众多邻域。研究对象也由人类扩展到有重要经济价值和研究价值的动植物、微生物等。

SNP分型检测技术服务

SNP(single nucleotide polymophism)，即单核苷酸多态，是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说，一个SNP位点只有两种等位基因，因此又叫双等位基因。SNP在人基因组中的发生频率比较高，大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点，是继微卫星之后的第三代遗传标记。有些SNP位点还会影响基因的功能，从而导致生物性状改变甚至致病。 

SNP研究包括SNP发现（discovery）、SNP验证（validation）以及SNP筛选（Screening or Scoring）。广泛用于群体遗传学研究（如生物的起源、进化及迁移等方面，将逐渐取代微卫星而成为新一代的分子生物学标记）。和疾病相关基因的研究，在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。SNP的分布不均匀，非转录序列中要多于转录序列，绝大多数位于蛋白的非编码区。虽然SNP不及RFLP和短串联重复序列STR标记变异程度高，但由于数量巨大，分布频密，因此就整体而言，其多态性要高得多。  

1. 直接测序法进行SNP分析
 在所有SNP的检测方法中，对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法，也是SNP分析的金标准。通常情况下，纯合型SNP位点的测序峰为单一峰型，而杂合型SNP位点的测序峰为套峰，因而很容易将其区分开来。通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%。

1）操作流程:

• 样品基因组DNA提取

• 根据不同的区域进行引物设计、合成

• 对所有样品进行基因扩增并纯化

• 测序

• 统计与分析

2）样品要求：
血液样品：样品为EDTA抗凝或枸椽酸钠抗凝，样品量大于1ml，样品采集后于-20℃或-80℃保存；
组织样品：样品可以为新鲜组织（最好-80℃保存）、石蜡包埋组织或95%乙醇中固定的组织，组织量大于50μg 细胞、菌液等。
3）提供结果:
实验流程、电泳图、测序图谱、SNP基因型统计结果等。

2.Taqman探针法（定量PCR）
客户根据实验要求挑选出SNPs后，提交给我们进行引物与探针设计与合成。上述工作完成后，客户提供2ug的DNA样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验。

1）技术特点：
适合位点数量少，样本通量高的检测（每个位点需要合成两条探针，探针合成费用高）；
应用ABI7900、ABI7500定量PCR仪进行定量检测；
操作简便，只需一步 PCR 反应，无须进行纯化和预处理，直接上机检测；
结果清晰，软件分析结果界面友好，标出了每个样本的基因型及荧光强度，非常直观；
可采用ABI合成的探针或国产探针。
2）样品要求：同测序法。
3）提供结果：实验流程、电泳图、定量PCR结果、统计分析结果等。

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SNP芯片/SNP检测/SNP分型价格

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