植物或农业分子生物学的研究，无论从哪个角度，用什么手段，最终目的都是一个，那就是寻找有应用价值的基因，进而应用于品种改良，也就是提高产量和品质，为分子育种和转基因打下基础。在基因芯片出现之前，人们仅能对单基因进行分析和检测，手续繁复、耗时长、成本高，不能满足人们日益增长的对大量基因信息进行快速而低成本检测的要求，特别是多基因综合作用而引起的产量，品质以及抗逆性等复杂性状。基因芯片则可以并行化、高通量的处理大量的基因表达信息，更有利于对有经济价值的农作物和水果等的基因组进行大规模高通量的研究，筛选农作物的基因突变，并寻找高产量、抗病虫、抗干旱、抗冷冻的相关基因，以开发高技术含量、高附加值的新产品。

SBC定制芯片服务

在不同的研究中，需要观察的基因并不完全相同，因此许多研究者往往需要针对自己感兴趣的一些基因进行表达分析。本项服务的目的，就在于满足不同研究者的需要。另外，有些物种尚没有商品化的基因芯片可以提供，也需要通过定制芯片来制备。

相关文章

1)    You-Jia Hua, Kang Tua, Zhong-Yi Tang, Yi-Xue Li, Hua Sheng  Xiao.  Comparison  of normalization methods with microRNA microarray.Genomics (2008)

2)    Zhang GQ, Guan YY, Sheng HH, Zheng B, Wu S, Xiao HS, Tang LH. Multiplex PCR and oligonucleotide microarray for detection of single nucleotide polymorphisms associated with drug resistance in Plasmodium falciparum.J Clin Microbiol (2008)

3)    Lian-Fang Li, Xiao-Jing Xu, Ying Zhao, Zhe-Bing Liu, Zhen-Zhou Shen, Wei Rong Jin, ZhiMing Shao. Integrated gene expression profile predicts prognosis of breast cancer patients. Breast Cancer Res Treat (2008)

4)    Yanmei Zhang, Xinye Zhang, Yuchen Chen, Qi Wang, Mingxiu Wang and Minren Huang. Function and Chromosomal Localization of Differentially Expressed Genes Induced by Marssonina brunnea f. sp. multigermtubi in Populus deltoids.Journal of Genetics and Genomics, 2007, 34(7): 641-648.

5)    Botao Zhao, Ruqiang Liang, Liangfa Ge, Wei Li, Huasheng Xiao, Hongxuan Lin,, Kangcheng Ruan and Youxin Jin. Identification of drought induced  microRNAs  in  rice.  Biochemical and Biophysical Research Communications, 2007, 354 (2):585-590.



植物类成品芯片服务

微阵列芯片技术在植物基因组学上的应用

植物发育生物学及植物抗逆性基因表达调控研究
植物发育生物学是研究植物个体发育规律及其调控机理的学科，可从植物自身的生长发育角度进行研究如细胞生长、器官分化与形成，激素形成及信号转导途径植物次生代谢，成花多因子途径、光合作用呼吸作用，植物生长调节剂调控机理等。对于植物生长发育的分子生物学研究如果单纯从单个基因水平研究将很难对作物的品种改良产生直接高效的影响，因此，需要使用微阵列芯片这一工具进行相关研究。
植物抗逆性研究涉及到植物对各种外界环境胁迫的各个方面。抗逆性研究更多的是研究外界剌激对植物生长发育的影响以及植物对外界剌激的反应，如果说生长发育研究是研究如何在理想情况下使植物获得最佳产量，那么抗逆研究是研究如何在极端条件获得最佳的产量。研究表明，在植物抗逆过程中发挥作用的基因绝大多数同样参与植物的生长发育调控。抗逆性研究与生长发育研究是殊途同归的。因此，也需要使用微阵列芯片这一工具进行相关研究。
   
作物品种资源研究与品种改良
利用基因芯片对品种资源进行大规模基因筛查，获得的表达谱信息，其信息量比现有的 RFLP，AFLP等传统方法获得的信息要丰富得多，可以进行重要农艺性状基因的筛选与鉴定以及表达调控研究；已经有科学家利用其定制的玉米芯片对不同的玉米胚乳突变体进行遗传分类。 同时，还可以进行突变体的DNA水平的筛查， 如提取两个(几个)不同突变体的DNA与该物种的表达谱芯片进行杂交，比较两组突变体的信号差异，可以获得该物种所有在探针设计区域内的遗传差异，通过查询相关数据库，即可获得所有突变产生的具体位点。获得的特异基因，还可以进一步开发利用于种质资源的筛查与鉴定。

转基因植物表达调控研究及转基因作物和农产品的检测
目前转基因植物的研究多集中在对目的基因的密码子修饰以及启动子区域的修饰，以使目的基因更高水平的表达，这些研究都是集中在目的基因本身表达调控的研究。但实际是，外源基因进入植物体以后引起的反映是多方面的。因此，单个基因水平的研究很难准确判断外源基因进入植物体后的全貌，也就很难使外源基因更有效的表达。比如说，对外源基因启动子的修饰，可以提高外源基因的表达效率，但如果该外源基因所处的表达群体的总体开关是关闭或受抑制的，那对本身启动子的修饰将很难达到最佳的效果。而基因芯片获得的全面数据，有助于判断外源基因所处的表达群体，并可以对该表达群体共同的表达调控区域进行研究，将更有助于提高外源基因表达效率的研究。利用基因芯片，还可以快速准确地进行转基因植物的鉴定以及生物安全问题研究，转基因农产品以及进出口的蓄禽产品的检测等方面。

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