简化基因组测序(Reduced-Representation Sequencing)技术,如RAD(restriction-site associated DNA tags)和GBS(Genotyping By Sequencing),利用限制性核酸内切酶识别基因组相关位点,对酶切获得的Tag序列进行高通量测序,能够降低基因组的复杂度,快速鉴定出成千上万的单核苷酸多态性(SNPs)标记。
鉴于其信息分析方法的独特性,简化基因组测序技术操作简便,同时不受参考基因组的限制,所得结果能用于任何物种超高密度遗传图谱的构建、基因定位以及群体分析。可以预期,随着测序和实验成本的进一步降低,简化基因组技术必将为复杂动植物基因组相关研究提供便利。
应用范围
★分子标记的开发
★超高密度遗传图谱的构建
★群体遗传分析
美吉优势
★ 承诺图谱密度指标、标记个数。
★ 可以做四倍体物种的高密度SNP标记遗传图谱。
★ 提供图谱总遗传距离,负责客户性状定位工作。
★提供客户文章写作方法部分文字、项目相关表格和图片。
★ 灵活的价格策略。
生物信息分析
1. 依赖于参考基因组的信息分析流程
1) 数据质量评估
2) 分子标记开发
3) 超高密度遗传图谱构建
4) 群体遗传分析
5) 基因组草图绘制
2. 不依赖于参考基因组的信息分析流程
1) 每个样品内reads的聚类
2) 不同样品之间consensus序列的聚类
简化基因组测序价格
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