全基因测序的下一代测序为基因芯片打开大门

　　虽然有关全基因测序的话题在今年的美国医学遗传学会(ACMG)年会上受到热议，但因受制于多方面因素，可取的内容有限。这些因素包括：如此广泛测试如何更好地获得知情同意，哪些结果应该报告，确凿的结果是否总应该披露，以及保险覆盖问题。不过，用于全基因测序的下一代测序(NGS)技术已经为正在应用于患者的基因芯片打开大门。

　　NGS可同时检测与疾病有关的多个而非单个突变基因，某个具体芯片包含多少个基因并无真正限制。与初级保健机构关系最为密切的是近来与癌症相关芯片的广泛应用，初级保健医生很可能面临如何处理这类检测的问题。

　　BRCA1 和 BRCA2仍然是乳腺癌易感性检测的热门基因，因为大约5%的乳腺癌病例与之有关，并且已经出台了相关检测和突变携带者诊治指南。然而，其他基因对于确定乳腺癌风险也非常重要。尽管这些突变并不多见，但其作用已在文献中得到确认。它们与乳腺癌以及其他癌症存在关联，属于中至高外显率突变。这些基因突变的发现往往可导致医学诊治的改变。利用NGS芯片，BRCA Negative Panels可对上述基因连同最新发现的其他与乳腺癌相关的基因进行评估。这些NGS芯片提供的信息对于治疗更具操作性，并且在确定个体风险方面更为准确。即便如此，其临床应用仍取决于基因谱。

　　例如，在家族性乳腺癌患者中已经发现某些基因(如CHEK2、ATM和PALB2)，但目前没有针对这些患者的治疗标准或循证指南。譬如，如果患者小于40岁，尚不清楚除乳房X线检查之外何时需要进行乳腺MRI检查以及初始筛查年龄，也不明确保险是否能够覆盖此类筛查。我们仍在探索某些基因(如 BRIP1 和 RAD51C)对癌症风险的影响以及是否具有乳腺癌之外的其他风险，它们对乳腺癌风险的影响程度也有待确定。

　　但似乎肯定的是，初级保健医生和遗传学专业人员应尽全力确定符合“高危”乳腺癌筛查方案的患者。筛查方案可能涉及每年乳房X线检查以及乳腺MRI检查、每6个月进行临床检查和每月自我乳房检查。美国癌症学会(ACS)推荐上述方案用于在家庭风险模型评估中乳腺癌风险≥20%的女性，她们的乳腺癌风险大约是普通人群的2倍。

　　我们是否应该向低外显率基因检测结果阳性患者推荐高危筛查方案?如果可以，从什么年龄开始?在大量数据支持MRI筛查不应继续开展(如同BRCA1和 BRCA2筛查)但它仍可能具有临床意义的情况下，我们是否能够向保险公司证明MRI筛查的合理性?

　　基因技术发展步伐将会继续领先临床应用数据的产生，初级保健医生和遗传学专业人员合理判断基因检测对患者诊治的临床意义则显得尤为重要。

　　Hulick博士是伊利诺斯州埃文斯顿北岸大学健康体系医学遗传学专家、芝加哥大学普利兹克医学院临床助理教授，他报告无相关利益冲突。