蛋白质的分组重量编码及在结构型预测的应用

摘要: 从氨基酸的物化特性出发, 利用物理学中“粗粒化”思想, 提出了一种蛋白质序列的分组重量编码方法( Encoding Based onGrouped Weight, 简记为EBGW) , 并结合组分耦联算法进行结构型预测的研究。对标准集T359 中359 个蛋白质的Resubstitution检验和Jack- knife 检验预测准确性分别达到99.72%和91.09%, 其中Jack- knife 检验总体预测精度比相同条件下采用氨基酸组成编码的方法提高了约7%, 特别是!+" 类的预测精度提高了15%。实验结果表明蛋白质序列的EBGW编码方法能够有效地提取字母序列中蕴含的结构信息。