质谱样本制备技术资料

上一篇 / 下一篇  2012-07-07 17:43:03

  试剂耗材:

  Milli-Q water、Non-powder gloves、Face mask、Hat、10μl and 200μl tips(eppendorf)、Menthol(Fisher M/4056/17)、Acetonitrile(Fisher A/0626/17)、Trypsin (Promega V528)、Trypsin resolve solution(Promega V530)、Ammonium bicarbonate(Sigma A6141)、ZipTip μC-18(Millipore ZTC18M096)、TFA(GE HealthCare)、0.2ml and 0.5ml EP tube(eppendorf)、50ml EP 0.5ml EP(Corning)

  用具仪器:

  真空干燥仪、水浴锅、10μ和200μ移液器、废液缸、制冰和装冰设备、200μ管架、剪刀、能装放置了200μ管管架的塑料盒、200μ管离心机。

  准备:

  1. 0.2ml EP管三套,MilliQ水和甲醇各涮一遍,真空干燥。

  2. 50ml EP管六支,MilliQ水和甲醇各涮一遍,真空干燥。

  3. 胰酶储液制备:使胰酶粉末沉落瓶底,用100μ胰酶重旋液溶解,用0.5ml EP分装成5μl。

  4. 50ml 100 mM NH4HCO3。

  脱色酶切:

  1. 切点将200μl tip头剪成吸口1.5mm左右的直径,MilliQ水涮洗一遍,吸100μl水后戳取斑点,将胶粒打入0.2ml EP管中,吸干水后再用MilliQ水洗涤两遍,吸干。

  2. 脱色 180μl 50%MeOH/50mM NNH4HCO3脱色两次以上,每次半小时;180μl MilliQ水洗涤5分钟,180μ 50% ACN洗涤5分钟,180μl 100%ACN洗涤5分钟;真空干燥半小时。

  3. 酶切

  ① 25 mM NH4HCO3稀释胰酶至12.5μg/μl;每管胶粒加入胰酶3μl,冰浴15分钟后洗掉多余的胰酶;再加入3μl左右25 mM NH4HCO3至覆盖胶粒。

  ② 小心将EP管倒转,将整个EP管架放入塑料盒中后放入37度水浴锅酶切16小时。

  ③ 将塑料盒从37度水中捞出,注意不要倒掉水,冷却至室温。

  ④ 加入10μl 25 mM NH4HCO3,震荡15分钟,离心后收集至新管;

  加入10μl 2.5%TFA,震荡5分钟,收集至上管;

  加入10μl 2.5%TFA-50% ACN,震荡5分钟,收集至上管;

  加入10μl 100% ACN,震荡5分钟,收集至上管。

  ⑤ 将此收集液真空浓缩至5-10μl后,加入20μl 0.5%TFA;继续浓缩至10-20μl。

  肽段浓缩除盐:

  1. 吸10μl 100% ACN,弃之,重复两次;

  2. 吸10μl 0.1% TFA,弃之,重复两次;

  3. 吹吸样本15次;

  4. 吸10μl 0.1% TFA,弃之,重复两次;

  5. 吸3μl 0.1% TFA-50% ACN,将此洗脱液转入新EP管。


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