基于P2HP 平台的蛋白质折叠分布式计算

摘 要：通过对基于格点模型的PERM 算法进行定性分析，提出并行化计算PERM 算法的策略。该策略保存了PERM 算法中最关键的平均权重向量，并分发至多个计算单元进行模拟运算，从而达到减少计算时间、提高运算结果精确度的目的。以P2HP 为计算平台，对多条蛋白质序列进行模拟运算。实验结果表明，基于PERM 的蛋白质折叠并行计算方法能够在P2HP 平台上获得较优的性能。