Neosuite TCMD 中药化学数据库

上一篇 / 下一篇 2019-09-06 10:06:29 / 精华(1)/ 置顶(1)/ 个人分类：研发创新平台

文件版本: V1.0
开发商: 创腾科技官网
文件来源: 本地
界面语言: 简体中文
授权方式: 免费
运行平台: Win9X/Win2000/WinXP

(Traditional Chinese Medicine Database, NeoSuite)

中药新产品开发和现代化研究的综合信息源，采用国际规范的信息表达体系全面定义了中英名称，化学结构，各类数值，生物活性等数据。目前该库收集化合物 23,033 种（截至 2009 年），其中 8000 种成分有药理数据。涉及中药药用植物 6735 种，参考文献 5507 篇（截至 2005 年），200 种细胞水平抗癌模型，包括细胞因子网络调节机制抗炎模型，各种抗氧化模型，酶抑制剂模型，NO 抑制剂模型等。

产品介绍
中药化学数据库 (Traditional Chinese Medicines Database，TCMdb2009 中文版) 是中科院过程工程研究所分子设计课题组在长期从事药物设计方法研究的背景下，对数据库工具的国内外需求进行分析，经多年努力研制成功的科学数据库产品，是一个支持新药研发和中药现代化研究的新型工具。

TCMdb2009中文版是一个多学科交叉的科学数据库，涉及中药现代化研究、中药化学、药物化学、植物化学、化学信息学、中药药理学、分子药理学、药物设计学、天然产物研究与开发、新药创制、新剂型中药研发、新农药及其它农用化学品的研发等诸多研究及开发领域。

TCMdb2009 中文版中包含了 23033 种化合物，涉及中药药用植物 6735 种，使用参考文献 5507 篇。每种化合物下列 12 项数据：唯一代码、CAS 登录号、中文名称、英文名称、别名、分子式、分子量、二维结构式、植物来源、药理活性（即药理模型实验结果，近 8000 多种化合物有此数据）、物理化学性质（晶体形态、熔点、沸点、旋光度等，14000 多种化合物有此数据）和参考文献。

产品特点：

• 8000 种成分有药理数据：200 种细胞水平抗癌模型；细胞因子网络调节机制抗炎模型；各种抗氧化模型；各种酶抑制剂模型；NO 抑制剂模型等等。

• 信息表达体系完整严格：按国际规范全面定义了中英名称、化学结构、各类数值、生物活性等数据结构、层次及格式，使相关学科信息表达和国际接轨。

• 保证数据一致性可靠性：采用多种交叉验证方法保证信息准确可靠。化合物立体化学表达完整，并首次实现了药理数据多层次结构规范化。

无论您是从中药设计新西药，还是研发新剂型新中药，都可以把 TCMdb 中药数据库作为一种得力的工具，帮助您以最快速度分析并做出决策，解答任何与中药有关的问题：

• 有多少化学成分做过抗癌实验，哪些有活性？哪些没有？IC50 值多少？

• 以心血管药物为研发目标的公司应该关注哪些中药的研发动态？

• 从中药出发创制抗高血压新药，哪些资源成功希望最大？

• 黄酮类化合物有多少种药理活性？哪些活性最强？哪些活性谱最广？

• 中药传统药效有清热、安神、解表、活血等，对应的药理学概念是什么？

应用实例
从植物检索化合物
给定一种中药药用植物，问该种植物都含有哪些化合物？严格的说法是：都有哪些化合物被从该种植物中分离并进行了结构确定？，TCMdb2009中文版数据库能方便地完成这个任务。以三七为例，单击菜单栏下方的“Query”按钮，在query模式下激活“植物来源”域，键入“Like “%三七%””时，单击菜单栏“Search”按钮，单击下拉菜单中的“By Form”，系统将扩展地检出各种三七中含有的全部化合物，包括竹节三七等。

类别	方式	检索域	键入	命中数	注解及说明
单项	SBF	植物来源	Like “%人参%”	180	检出各种人参中含有的全部化合物
单项	SBF	植物来源	Like “%三七%”	156	检出各种三七中含有的全部化合物，注意包括竹节三七等

化合物药理活性数据检索
在全库的 23033 种化合物中，7000 种化合物有药理活性数据。这是研究QSAR/SAR关系的珍贵信息。用 SBF 方式，激活 “药理活性” 域后，键入“Like “%药理关键字%””，之后单击菜单栏 “Search” 按钮，单击下拉菜单中的 “By Form”，就得到下表中的结果。亦可采用 QB 方式，见下表中中间的三个例子：

类别	方式	检索域	键入	命中数	注解及说明
单项	SBF	药理活性	Like "%金黄色葡萄球菌%"	428	428个化合物有抗金黄色葡萄球菌数据
单项	SBF	药理活性	Like "%细胞毒%"	2519	2519个化合物有体外抗肿瘤数据
单项	QB	药理活性	property12 like "%抗肿瘤%"	638	638个化合物有体内抗肿瘤数据
单项	QB	药理活性	property12 like "%抗高血压%"	219	219个化合物有抗高血压数据
单项	QB	药理活性	property12 like "%抗肿瘤%" or property12 like "%细胞毒%"	2916	2916个化合物有体外或体内抗癌数据
单项	SBF	药理活性	Like “%抗疟%”	250, , ,	250个化合物有抗疟数据

注意: 体外抗癌活性在库中的规范表达方式是“细胞毒”，体内抗癌活性在库中的规范表达方式是“抗肿瘤”。观察化合物生物活性索引中的生物活性规范表达方式对于熟练使用数据库是有好处的。

结构检索
结构及子结构检索是 TCMdb2009 中文版特有的功能。这一功能的实现对进行 QSAR 研究，进而研发新药提供了巨大的帮助。这里只举出最简单的例子：将黄酮类化合物的特征分子骨架放入 SBF 方式下的 structure 检索域，从库中检出包含黄酮骨架的化合物 511 个。具体命令见 2.2 节。用 β-D-葡萄糖的分子骨架 (含确切的立体化学信息) 提问，得到 1455 个命中化合物。其它例子见下表：

类别

方式

检索域

键入

命中数

注解及说明

单项

SBF

二维结构

1099

黄酮类化合物552个

单项