基因和蛋白质的批量注释系统UBROAD

摘要: 以DNA 微阵列、二维电泳、二维高压液相色谱和质谱等技术为代表的转录组和蛋白质组高通量实验技术,能够产生海量的基因或蛋白质数据,对这些基因或蛋白质的注释是对相关数据进行后期处理的基础和必要条件. 海量数据的注释人工难以完成,而目前基因和蛋白质的批量注释网站给出的注释又往往不够全面. 在比较常用基因和蛋白质的批量注释网站的基础上,本工作研发了基因和蛋白质的批量注释系统UBROAD(Unified Batch Retriever ofAnnotation Data) ,该系统整合了NCBI、Swiss2Prot 、BINDenzyme - expasy、gene2accession 和gene2Unigene 6 个有关基因和蛋白质的数据源; 支持UniprotPtrEMBL AC、Uniprot Entryname、Genbank Protein Accession Number、Genbank mRNA gi、Genbank mRNA Accession Number、Genename、Gene ID 和Unigene ID 8 种登录号混合查询;含有各种登录号以及基因或蛋白质的基本信息、功能分类、相互作用共38 项注释项供选择;提供微软电子表格形式的注释结果. 可以通过访问网页http :PPwww. bioscience. org. cnPubroad 免费使用该系统.