mRNA与蛋白质

表达DNA转录为mRNA，再翻译为蛋白质。不可滥用。mRNA产生后不一定就能翻译为蛋白质，如卵母细胞母源信息mRNA，受精卵发育初期才表。由mRNA被一些蛋白质结合，也可能其他原因如小分子RNA作用。

mRNA的选择性运输

细胞不同情况下选择地将不同hnRNA加工成mRNA运至细胞质，--mRNA的选择加工运输,一种通核孔的主动运输方式，可能机制大：1.依赖核孔复合体上受体蛋白对RNA分子的特异性识别，缺少识别信号便保留在核内；2.不需要识别信号，除被特别保留在核内的RNA外：其余RNA自动输出细胞核；3.存在选择输出保留的联合机制。

翻译水平调节
主要是控制mRNA的稳定性和mRNA翻译起始的调控。
所谓在翻译水平上的调节，是说基因转录的各种mRNA并不都能翻译成蛋白质，在不同细胞中有不同的mRNA得到翻译，结果不同细胞具有不同的蛋白质，细胞内才有了差别（分化），是否有这种调节机制呢？
早就注意到在海胆未受精卵中存在着较稳定（未活化）的mRNA，这种mRNA只有在受精后才能翻译，称为母体mRNA（maternal mRNA）。推测这种mRNA可能在未受精卵中被蛋白质遮盖，或被局限在细胞内某一特定区域而不能被翻译。而在受精后从这类束缚中解放出来，开始翻译成蛋白质。所以认为，在真核细胞对基因表达调节的一条重要途径是产生稳定性的mRNA，处于隐蔽状态，在一定条件下进行翻译。

除了和蛋白结合，不导致能翻译为蛋白外，这里我要重点提出miRNA，可以对翻译水平上进行调节，使蛋白不表达或直接降解mRNA，主要研究的热点是和肿瘤抑制基因和癌基因的关系。

mRNA代表基因转录水平，protein代表翻译水平，表示功能，常常还要做免疫组化，进行组织定位和亚细胞定位，三者不能互相替换，

虽然说mRNA和蛋白水平是一个相偶联的过程，但是两者没有必然的一致的趋势，因此不一定mRNA水平升高了就一定蛋白浓度就会提高，反之亦然。mRNA水平升高代表的是启动子或者增强子的激活，也许是上游转录因子的激活，而蛋白水平的提高则大多数和功能增强相偶联。机体是一个相互协调一致的整体，因此两者的变化往往是相互偶联的，因此验证两者的关系对于确认某个基因的激活是相当有力的。
免疫组化或者免疫荧光都是反应细胞内某种蛋白定位或者形态学上的一个大致的变化趋势的，并不能确切说明变化的形式，因此我认为如果缺少形态学的证据只要在蛋白水平验证即可，毕竟都是反应蛋白水平的，当然反应细胞内定位的情况就另当别论了。

细胞中蛋白水平取决于：
1。 基因拷贝数和基因表达水平
2。信使RNA翻译为蛋白质的水平
3。蛋白质在体内降解的水平 

基因表达有转录和翻译两个水平，但是调控就有很多水平，同一个基因可以有不同的转录本，而且mRNA可以有不同的剪接方式，因此一个基因可以有多个蛋白质。基因转录至mRNA其后再到蛋白质还有几个水平的调控，也可能mRNA不需要翻译为蛋白，就降解了，也可能翻译到一定水平后，获得另外的信号，而停止翻译

从mRNA到protein是一个复杂的调控过程：这种现象我以前听说过，mRNA水平转录增多，但有可能翻译前降解增加，也可能没有翻译出功能蛋白。蛋白降低，可能降解加速（是特异性或非特异性），可能产生多聚体，要考虑检测手段。最重要的是考虑你试验设计这个大背景，考虑出现这种现象的特定意义

真核蛋白还存在一个翻译后加工问题。如果翻译后加工不正确，蛋白可能被内肽酶降解，也有可能活性降低。你可以做蛋白电泳，看蛋白的表达量是否变化.

转录和翻译是两个不同的过程，在某些特定的条件下可以脱节。但是首先要确定的确是mRNA升高，蛋白降低。请谈谈你在定量mRNA和蛋白表达水平时采用的方法！

机体存在生物钟.即以24小时为周期,许多基因的表达在这段时间里存在峰值(量多)和谷值(量少).因此您研究的基因如果有周期波动,您的结果就完全可能,因为有文献报告蛋白的表达比mRNA滞后3小时左右,因此您在现有的采样点后3小时再采样,可能蛋白表达量就与已有结果mRNA高一致.