基于质谱技术的计算蛋白质组学研究

中国科学  E 辑 信息科学  2006, 36(2): 222~234

孙瑞祥 1**       付    岩 1,2    李德泉1,2       张京芬1,2        王晓彪1,2       盛泉虎3    曾  嵘3       陈益强 1        贺思敏 1       高    文 1,2 (1. 中国科学院计算技术研究所,       北京 100080; 2. 中国科学院研究生院,     北京 100039; 3.中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所,              上海 200031)

摘要：蛋白质组是继人类基因组计划完成之后又一新兴的生命科学研究对象，蛋白质组学研究细胞或组织内所有表达的蛋白质，生物质谱技术已为蛋白质组学研究产生了大规模的质谱数据；而如何从这些数据中提取和发现有关蛋白质组的重要生物学知识为计算蛋白质组学的研究提出了重大需求，如蛋白质鉴定、翻译后修饰、定量分析，以及疾病模式的发现等。本文研究了如何应用计算技术来解决蛋白质组学研究中质谱信息处理的这几个关键问题。

关键词        计算蛋白质组学           质谱技术        蛋白质鉴定        算法     生物信息学