NanoLC-MS/MS鉴定IPG分离的K562 细胞株混合蛋白质

NanoLC-MS/MS鉴定IPG分离的K562 细胞株混合蛋白质
蒙 根 王海龙 刘炳玉 王鸿丽 李卫华 王红霞 魏开华# 张学敏 杨松成
（军事医学科学院国家生物医学分析中心，北京100850）
岑 坚 （海军总医院血液科，北京100037）

摘 要 用标准蛋白质混合物建立了一种适用于低丰度混合蛋白质及其异构体分离与鉴定的蛋白质组学方法。通过IPG 胶条等电聚焦分离蛋白质，染色后进行混合胶内酶切，采用纳升电喷雾毛细管液相色谱-串联质谱“散弹法（shot-gun）”分析酶切产物，并进行数据库检索鉴定蛋白质。运用该方法从K562 细胞株样品中鉴定出14 种具有重要功能的蛋白质，部分蛋白质同时在多个条带中出现，可能是异构体。肽段及其碎片离子的平均质量偏差小于0. 05 U，综合得分大都远远超过有效值。该方法灵敏、准确度高、分辨率高、省时、便于操作，在鉴定蛋白质异构体方面有优势。

关键词 等电聚焦，散弹法，蛋白质组学，串联质谱，K562 细胞株

http://www.antpedia.com/batch.download.php?aid=3882