蛋白质序列分析可获得蛋白质一级结构的信息。利用Edman降解测定蛋白质N-末端序列，在测定过程中，氨基酸残基依次与衍生化试剂（异硫氰酸苯酯）作用，从蛋白质N-末端顺序切割下来，形成稳定的氨基酸后进行分析鉴定。
微量蛋白质序列分析可用于确认新的蛋白质；鉴定重组表达的蛋白质结构的正确性，构建基因探针；鉴定多肽合成产物的结构。
样品要求：
仅含有单一蛋白链，蛋白质纯度大于97%。
不含干扰测定的物质,包括
1）影响Edman降解的反应条件
2）与衍生化试剂作用
3）与蛋白质N-末端残基发生作用
如：三羟甲基氨基甲烷（tris）, 甘氨酸（glycine）,胍（guanidine）, 甘油（glycerol）, 蔗糖（sucrose）, 乙醇氨（ethanolamine）, 十二烷基磺酸钠（SDS）, 曲通（Triton X-100）, 吐温（Tween）, 硫酸铵（ammonium sulfate），各种游离氨基酸等。
3.样品量：样品浓度在0.1mg/ml左右，总量达到50pmol以上。
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