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顶级期刊中的定量蛋白质组学进展—TMT标记的技术进展和临床应用


2020年04月16日 09:30

2020年04月16日 11:00

朱洪文,李嘉铭

生命科学  


内容简介

TMT定量的技术进展? Nature Methods一作向您娓娓道来

多组学数据的整合分析? Cell一作为您拨云见日

【报告日程

时间 报告人 单位 报告题目
09:30-10:15 李嘉铭 哈佛大学医学院 《新一代串联质谱标签系统(TMTpro)实现16通道蛋白质组定量分析》
10:15-11:00 朱洪文 中国科学院上海药物研究所 《多标TMT技术在肿瘤蛋白基因组学研究中的应用》

【报告简介】

《新一代串联质谱标签系统(TMTpro)实现16通道蛋白质组定量分析》

蛋白质组学对生物体内的所有蛋白质进行定性和定量分析。经过近年蛋白质组学技术不断发展,其在生物问题研究和药物研发等多方面都起着非常重要的作用。目前蛋白质组学技术仍面临三个主要挑战:分析速度,蛋白质组覆盖深度,以及定量分析的质量。

串联质谱标签系统(TMT)可以在一次实验中对多个样品在全蛋白质组水平同时进行定量分析,是应对以上三个挑战非常有效的策略。经过多年的发展,TMT标记试剂从最初的6通道已发展到11通道,但受其结构限制已经无法继续增加通量。新一代串联质谱标签系统(TMTpro)具有重新设计的质量平衡基团和新的基于脯氨酸的报告离子基团,理论上最多可以提供18通道标记。在本报告中作者将主要介绍16通道TMTpro标记试剂的应用,以及近年针对串联质谱标签系统的一些技术优化。

串联质谱标记系统从11通道增加到16通道不仅仅是增加通量,降低分析时间。基于16通道TMTpro标记试剂的策略代表了一个封闭的系统,在这个系统之内每个蛋白质可以在样品间无缺失值的被准确定量,并且16通道的实现允许了更加灵活和复杂的实验设计。TMTpro将会进一步推动定量蛋白质组学技术到达更高的通量和覆盖深度。

《多标TMT技术在肿瘤蛋白基因组学研究中的应用》

肿瘤生物学指研究肿瘤发生发展的分子机制以及肿瘤防治的生物科学。近些年来,随着质谱技术的发展,蛋白质组学方法在肿瘤研究中的应用越来越广,尤其是以蛋白质组学为核心的多组学分析是现在临床肿瘤大样本研究的热点。多标TMT技术可以实现多个肿瘤样本的同时分析,与肽段分级方法联用可以实现肿瘤蛋白质组的深度覆盖,进一步联合磷酸化富集方法可以实现磷酸化蛋白质组的深度鉴定和定量。我们利用TMT11标方法,对159例感染HBV的中国肝细胞癌病人的癌组织和配对癌旁肝组织样本,进行了大规模蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析,进一步整合基因突变、拷贝数变异、基因表达谱等信息,探究了肝癌肿瘤细胞的分子特征,全面解析了肝癌的发生和发展机制,为肝癌的精准分型与个体化治疗、疗效监测和预后判断提供了新的思路和策略。


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