20200416 多标TMT技术在肿瘤蛋白基因组学研究中的应用


2020年04月16日 14:00

2020年04月16日 14:30

朱洪文

赛默飞色谱与质谱

生命科学  

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内容简介

肿瘤生物学指研究肿瘤发生发展的分子机制以及肿瘤防治的生物科学。近些年来,随着质谱技术的发展,蛋白质组学方法在肿瘤研究中的应用越来越广,尤其是以蛋白质组学为核心的多组学分析是现在临床肿瘤大样本研究的热点。

多标TMT技术可以实现多个肿瘤样本的同时分析,与肽段分级方法联用可以实现肿瘤蛋白质组的深度覆盖,进一步联合磷酸化富集方法可以实现磷酸化蛋白质组的深度鉴定和定量。

我们利用TMT11标方法,对159例感染HBV的中国肝细胞癌病人的癌组织和配对癌旁肝组织样本,进行了大规模蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析,进一步整合基因突变、拷贝数变异、基因表达谱等信息,探究了肝癌肿瘤细胞的分子特征,全面解析了肝癌的发生和发展机制,为肝癌的精准分型与个体化治疗、疗效监测和预后判断提供了新的思路和策略。

主讲人简介

朱洪文,博士,2017年1月毕业于中科院生化细胞所,师从曾嵘研究员。2017年2月至2020年3月,在中科院上海药物研究所从事博士后研究,合作导师为周虎研究员,现为上海药物研究所特别研究助理。长期从事液相色谱-质谱联用和定量蛋白质组学相关技术和应用研究,迄今已经在Cell、Acta Pharm. Sin. B、IScience、Cancer letters等发表论文18篇。


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