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全转录组测序步骤

转录组测序流程步骤

以真核转录组测序为例,实验流程为总rna提取-mrna分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-ssr分析及snp分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。......

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转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mrna转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体 基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cdna文库,大规模cdna测序,收集cdna序列片段、定性、定量分析其mrna群体组成,从而描绘

2021-12-08 13:57

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转录组测序-仪器信息

通过全转录组测序可快速的获取某一条件下组织或细胞中大部分转录本的表达情况。与常规转录组测序相比,全转录组测序可以同时获得mRNA、lncRNA和circRNA三种类型的RNA信息。

全转录组(Whole transcriptome),是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和,基于二代测序平台,采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法,实现编码RNA和非编码RNA(miRNA, lncRNA, circRNA)的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceR

原核生物转录组测序是基于HiSeq平台,构建链特异性文库研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有mRNA。通过转录组测序研究可以揭示微生物不同表现型形成的分子调控机制。

转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的必然纽带。真核生物转录组测序基于高通量测序可快速地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的所有转录本的集合,用于研究基因结构和基因功能、可变剪接和新转录本预测等。

转录组,广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNA,rRNA,tRNA以及其他non coding RNA,狭义上指 mRNA 集合。 转录组测序,利用高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。