10x Genomics Chromium Controller 单细胞测序文库构建解码系统

10x Genomics Chromium Controller 单细胞测序文库构建解码系统

仪器主要用途：

应用微流体芯片将样品（高分子量DNA或单细胞）进行快速分区，而后添加序列标签，对样品进行定相结构变异分析、单核苷酸变异及插入分析，以及对数万个单细胞进行动态基因表达谱分析。可同时检测来源于同一细胞中表达谱及VDJ区域基因全长。可以检测单细胞水平基因拷贝数变异和开放染色质。应用Feature Barcoding技术可以在单细胞水平，同时检测同一细胞中基因表达以及细胞表面蛋白表达。提供开源的数据分析和可视化分析软件。
 

Chromium Controller仪器主要性能：

● 18分钟时间内捕获500-80000+个细胞

● 可同时检测1-8个样本

● 细胞的最小尺寸没有限制

● 细胞捕获效率可以达到65%

● 双细胞概率低：0.9%每1000个细胞

● 兼容Illumina测序系统

主要应用方向：

●  肿瘤异质性     ●  稀有细胞检测    ●  细胞发育机制    ● 单细胞RNA基因表达谱   ●  疾病路径调查    ●  功能基因的筛选    ●  丰富组织器官表型    ●  通路和细胞信号分析    ●  药物筛选    ●   基因特征识别     ●   了解克隆演化   ●   生物标志物的发现

研究领域：

● 免疫学    ●癌症研究    ●干细胞生物学    ● 免疫肿瘤学和免疫治疗   ● 自身免疫疾病和炎症性疾病   ●流行病学   ●神经科学   ●发育生物学   ●群体遗传学   ●移植和免疫重建   ●基因编辑   ●生殖健康   ●遗传性疾病    ●生物多样性    ●传染病和疫苗研究

单细胞基因表达谱：

● 兼容不同类型的细胞（细胞系、悬浮细胞、组织解离细胞、血液、细胞核等）

● 根据细胞表达谱对细胞群体进行聚类分析；

● 识别和区分不同的细胞类型

● 定义新的细胞类型和细胞状态

● 分析理解细胞异质性及其对生物系统的贡献

● 在不了解细胞亚型或细胞标志物的情况下对细胞群体进行表征

单细胞免疫组：

●可构建并解码5’基因表达谱文库， T细胞和B细胞受体VDJ区域全长测序文库

● 对单个T细胞内的TCR的α和β链匹配

● 对单个B细胞内的BCR的重链和轻链匹配

单细胞表观基因组学：

● 在转录起始位点（TSS）和调节区用富集信号检测开放染色质

● 研究和比较感兴趣区域的开放染色质● 基于开放染色质区和富集转录因子(TF)基序的细胞聚类

和鉴定

● 在不到一天的时间内完简单、精简的工作流程

● 原代细胞、新鲜的和冷冻保存的细胞系样品已进行过论证
 

单细胞基因表达的靶向方法：

●集中在你感兴趣的相关基因和路径上，使用综合的，预先设计的panel，能够添加多达200个自定义基因，或设计一个完全定制的panel。

●更高的通量和降低达90%的测序成本

●简化工作流程，同时保持较高的基因检测敏感性和降低计算负担

●在全转录组和同一个文库的靶向分析之间无缝过渡，以验证发现或探索新假设

●通过利用混合捕获方法来丰富文库，最大限度地减少偏差的引入
 

单细胞多组学：

同一细胞转录组和表观基因组的同时分析：

● 通过整合在同一细胞中的直接检测基因表达和表观遗传学，消除了在生信上推断关系的需要

● 确定认定的调节元件和它们的目标基因之间的联系

● 简单可靠的工作流程

● 易于使用的数据分析和可视化软件单细胞基因表达结合Feature Barcode技术

● 可同时检测同一细胞中基因表达以及细胞表面蛋白表达

● 可同时检测数万个单细胞中CRISPR介导的对基因转录水平的扰动

● 对细胞表面抗原特异性细胞进行表达谱文库和T细胞受体文库构建

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途