转录组和蛋白质组相关性分析

生命体是一个多层次多功能的复杂结构体系，基因表达不只是从mRNA到蛋白的单向传递，而是两者相互的动态作用。为了系统了解基因的调控机制，有必要在转录本和蛋白质层次上同步检测，互相关联分析。然而，当细胞经过转录水平、转录后（如mRNA的剪接）、翻译后（蛋白降解和输出）的精细调控机制后，转录物和蛋白质的表达水平可能会不一致。因此，定量的转录物和蛋白质丰度测量可作为相互的标准，为高通量分析得出的基因表达数据做出合理的解释。正如蛋白质和RNA之间类似点可以增加我们对新的生物标记的信任度一样，差异也能暗示我们“其他的转录后调控结合点可作为重要的调控研究靶点”。

武汉华美生物使用先进的高通量技术，可以在各个层次zei大限度挖掘转录组水平和蛋白组水平的相互关联，为寻找biomarker、mRNA和（或）蛋白质存在的可靠性、阐述复杂的生命活动机制增加更有力的证据。

现可提供的转录组和蛋白质组相关性分析如下：

1、基因分别在基因组、转录组、蛋白质组层次的定性关联分析

通过这种“全景式”的分析比较，可实现期间的互补和整合、对生物体中基因及其表达产物的全方位分析。

2、转录组、蛋白质组样品间表达量变化关联分析

我们全面分析两个层次基因上下调关系（如mRNA和蛋白表达量变化一致且显著、mRNA和蛋白表达量变化一致且不显著、mRNA和蛋白表达量变化相反）（如图1），更细致的为您呈现其中的转录翻译调控机制。

图1：转录组&蛋白质组表达量变化关联分析

3、转录组、蛋白质组等不同层次表达模式聚类分析。

即从整体上观测各层次的差异基因聚类情况。

4、差异蛋白/mRNA的Pathway分析

按照2中对mRNA和蛋白表达量变化的不同状态（如图1），分别对其做Pathway通路分析，试图找出一些具有意义的基因。

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