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降解组测序主要针对miRNA介导的剪切降解片段进行深度测序,从中筛选miRNA作用的靶基因,并结合生物信息学分析确定降解片段与miRNA的精确配对信息。该技术能从细胞或组织中准确高效地筛选出miRNA的靶基因,为研究miRNA与其对应的靶基因的相互关系提供准确、高效的筛选手段。降解组测序技术已被广泛应用于靶基因功能研究、生物性状控制研究、发育进展研究、致病机理研究及药物研发等领域。
技术优势
研究内容
miRNA 是针对靶基因,在转录后水平进行调控的一类21nt-24nt的非编码RNA,其中一种调控方式是通过与靶基因的完全互补,诱导沉默剪切复合体在特定位点剪切,沉默靶基因。传统预测miRNA靶标的方式主要是依靠计算机模拟后进行验证,假阳性的发生率极高。随着高通量测序的发展,直接测序得到mRNA的降解片段,通过后续的信息分析,不仅能够准确分析小RNA及靶基因,还能发现新的小RNA。
一、标准信息分析
数据统计、评估;
分析样品间的公共序列及特有序列;
探索降解片段在选定的参考基因组上的分布;
去除polyN片段;
与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA等ncRNA数据库比对;
对降解片段进行分类注释。
二、高级信息分析
鉴定mRNA降解片段;
统计mRNA降解位点信息;
利用miRBase中的miRNA,鉴定与mRNA降解相关的miRNA。
三、定制化信息分析
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。
更多详细信息请访问
http://www.bgitechsolutions.cn/service-solutions/ngs/transcriptomics/degradation-sequencing/
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途