转录组+蛋白质组联合分析

发布时间：2022年07月

· 产品定义

转录组学和蛋白质组学都是获得基因表达情况的重要工具，从生物学角度上看，转录组代表了基因表达的中间状态，可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理；而蛋白质是生物体直接的功能执行者，因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势。要全面探究生物体疾病机理、胁迫机制，精确研究重要基因的表达模式和调控机理，只有联合转录组学和蛋白组学表达量数据对生物样本进行系统研究，才能真正观察到mRNA-蛋白质关联性，进而从整体上解释生物学问题。

· 技术优势

1. 构建蛋白质数据库，大幅度提高蛋白质鉴定数量

2. 不同层面表达水平分析，构建表达“全景图”

3. 多组学交叉验证：深层次挖掘其中调控机制

4. 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证

5. 精准医疗：实现genomics到protegenomics的转变

· 数据分析

· 部分数据分析结果展示

· 推荐应用领域

生物领域各个研究方面，如：

1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等

2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等

3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等

4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等

5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等

6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等

7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等

8. 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等

· 项目案例

文献名称：Trisomy 21–induced dysregulation of microglial homeostasis in Alzheimer’s brains is mediated by USP25

发表期刊：《Science Advances》（IF=14.136）

合作单位：南方医科大学

文章摘要：由21号染色体三体性引起的唐氏综合征（DS）是早发性阿尔茨海默病（AD）最重要的危险因素；然而，DS和AD之间的潜在联系机制仍不清楚。本研究发现小鼠DS-AD杂交小鼠模型（5×FAD）中，同源21号染色体基因的三倍化加重了神经炎症。USP25是一种由21号染色体编码的去偶素化酶，过表达Usp25会导致5×FAD小鼠脑中小胶质细胞激活，加重5×FAD小鼠突触功能和认知缺陷；而敲除Usp25基因则可以减轻小胶质细胞激活和神经炎症，逆转5×FAD小鼠的突触功能和认知缺陷。从机制上，研究团队发现USP25介导WDFY1和ATP6V0C的去泛素化修饰，从而减少小胶质细胞炎症因子释放及突触吞噬。该研究通过遗传学和药理学方法证明了21-三体与阿尔茨海默病中小胶质细胞激活和神经炎症的关联性，指出USP25可能作为阿尔茨海默病和唐氏综合征潜在的治疗靶点。

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途