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Illumina HiSep 2500测序系统

参考报价: 面议 型号: Illumina HiSep 2500测序系统(测序仪)
品牌: illumina 产地: 美国
关注度: 103 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

产品介绍:

 

HiSep 2500新一代测序仪

前所未有的灵活性

HiSeq 2500系统是Illumina第一台特有两种运行模式的测序系统,包括快速运行和高产量运行模式,可使用一个或两个流动槽,使之成为一个灵活且可扩展的平台。快速运行模式提供快速的结果、数量有限样品的高效处理,以及更长的末端配对150 bp读取,这带来了更深度的覆盖,并改善de novo应用的组装。高产量模式特别适合样品量较多的大型研究,或需要最深度覆盖的应用。高产量模式可处理的样品量是快速模式的~5倍,让大型项目可通过尽可能少的运行来完成。

HiSeq 2500的多个配置让产量可调,既能在7小时内获得~10 Gb或~3亿个单端读取,又能在11天内获得600 Gb或60亿个末端配对读取,这取决于应用需求或项目期限。高效的样品批处理从未如此简单,而周转时间也从未如此之快。HiSeq 1500也具有这两种运行模式,支持单个流动槽,而不是两个。HiSeq 1500/2500系统让您的实验室拥有前所未有的灵活性,以便支持最广泛的应用和研究规模。

惊人的速度和通量

快速运行模式是HiSeq系统设计上的一个革命性附加,它通过缩短的循环时间和内置的簇生成来显著加快运行。在快速运行模式下,您能够完成全自动的簇生成和测序,在一个工作日内实现短读取应用,或在一天多的时间内通过末端配对100 bp读取实现全基因组测序应用。数据通量超过100 Gb,因此一天内人类基因组的测序覆盖度超过30倍(图1)。在需要快速且准确的答案时,快速运行时间再加上卓越的数据质量很关键。快速运行模式的加速运行以及平行处理约6亿个测序模板的能力带来了现有测序系统中最高的每日通量。

 

图1:前所未有的灵活性支持多个应用

 

有了两种运行模式以及使用一个或两个流动槽的能力,HiSeq 2500支持广泛的应用和研究规模。本图中的数据是例子,基于使用两个流动槽的系统性能。因簇密度、样品质量,及其他实验因素不同,可能会出现差异。运行时间是近似的,快速运行模式包括簇生成和测序,而高产量模式只包括测序。添加索引的运行时间未包括在内。

出色的数据质量

 

高的数据质量是通过行业中最广泛采用的边合成边测序(SBS)技术的应用来确保的。HiSeq 1500/2500系统的SBS技术利用专利的可逆终止子方法对数百万个片段进行测序,在单个碱基掺入增长的DNA链时检测它们。由于每个测序循环中四种与可逆终止子结合的dNTP都存在,故自然竞争让掺入偏向最小化,与其他技术相比大大降低了原始错误率。最终结果是高度准确的base-by-base测序,几乎避免了序列背景特异的错误,即使是在那些重复序列区和同聚物中。Illumina测序带来了行业中任何覆盖水平的最准确人类基因组、最高产量的无错误读取以及最高比例的>Q30碱基检出(图2)。

图2:快速运行模式下的读取 vs. Q值

快速运行模式下HiSeq 2500系统上人类基因组2 x 101 bp运行的质量值。这个例子表明,92%的碱基高于Q30。

卓越的数据质量和存储方案

Illumina生物信息学的新发展包括数据压缩改善、测序比对算法更快,以及一套即插即用的数据计算和存储方案。

HiSeq 1500/2500软件将数据体积缩小50%以上,而不会损害数据质量。这允许产量加倍,而无需将数据存储能力扩大两倍。HiSeq 1500/2500软件还能够与BaseSpace® 实时连接,这是一种云计算环境,可实现实时的碱基检出、比对后的数据分析以及可扩展的数据存储。将数据上传至BaseSpace可实时进行,通常在运行完成几分钟后结束。BaseSpace中的数据上传、数据比对或变异检出不会产生任何额外的费用。研究人员可通过BaseSpace云端开展合作,与世界上的任何人即时安全地共享数据。

BaseSpace还提供Illumina序列分析和比较软件(iSAAC™)- 目前最快的比对软件。iSAAC软件的速度有了4-6倍的提高,可在几小时内将一个30x的基因组与参考基因组比对。比对可在BaseSpace中免费开展,或利用经济的商业化计算硬件开展。iSAAC软件对生物学家而言简单易用,而对生物信息学家而言又足够灵活,可访问并修改开放源代码。BaseSpace应用商店将提供更多的工具和软件,带来商业化、免费软件和用户开发应用的组合。

研究人员也可使用IlluminaCompute™,这是一套即插即用的测序数据计算和存储方案。IlluminaCompute特有来自我们的合作伙伴Dell和EMC Isilon的行业领先技术,来自Illumina客户解决方案的安装和维护,以及一套预置的软件,用于数据处理、比对和变异检测。有了IlluminaCompute,实验室可在几周而不是几个月内全面投入运作,甚至无需预先购买IT设备。

 


Illumina HiSep 2500测序系统信息由埃克森(北京)科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于Illumina HiSep 2500测序系统报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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