青岛能源所蛋白质主链酰胺基合作研究取得新进展

2010-8-27 11:14 来源: 中国科学院
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  近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所仿真模拟团队负责人姚礼山研究员与美国国立健康中心Ad Bax研究小组合作,在《美国化学会志》(JACS, 2010, Volume 132, Page 10866–10875)上发表了一篇关于蛋白质主链酰胺基上质子的化学位移各项异性张量的研究文章。

  该研究以蛋白质GB3为研究对象,测量了大量的残余化学位移和化学位移各项异性/偶极-偶极交叉弛豫数据。通过模型拟合,研究首次确定出了酰胺基质子的化学位移各项异性张量而无需引入人为的假设——即该张量是相对于肽平面对称。

  实验结果表明,不同酰胺基质子的化学位移各项异性张量有较大差异。进一步的密度泛函量子力学计算表明,该差异主要是由酰胺基质子和其他基团形成氢键强弱不同造成的。文章提出一个经验公式用来描述氢键和该张量的关系,并达到较好的效果。该研究还发现,不同的酰胺基质子TROSY效应差别很大,平均大约1200兆赫兹的磁场会产生最窄的线宽。

  该研究为更好地理解酰胺基质子的化学位移各项异性张量奠定了基础。研究中发展和使用的一些先进技术方法对其他相关研究也有借鉴意义。