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华人学者巧妙利用细胞的职业道德

2016.3.23

  最近,华盛顿大学的一个工程师团队,提出了一种方法,通过利用细胞的职业道德,来提高生物燃料、药物、材料和其他有用化学物质的生产。

  该研究小组,由工程与应用科学学院能源、环境与化学工程助理教授张福中(Fuzhong Zhang)带领,发现基因完全相同的微生物细胞,有不同的职业道德。该团队开发了一种工具,以确保勤勉的细胞能保持努力工作,而好吃懒做的细胞则被淘汰。这一研究发表在3月21日出版的《Nature Chemical Biology》。

  当设计细菌生产有用的化学物质时,来自同一祖先的细胞,通常执行不同的任务。通过利用工程设计的大肠杆菌菌株,张博士的团队证明,只有一小部分的细胞努力工作,生产所需的化学物质,而其他大部分的细胞则满足于不工作,但却摄食为工作细胞提供的营养成分。他们发现,不同的职业道德,不是由非预期的基因突变所导致的,而是由生物学中的“噪音”造成的,这是大自然固有的,不可能消除的。

  为了防止懒惰的细胞浪费营养物,张博士的研究团队开发了一种质量控制工具,称为PopQC,能够使勤劳的、高性能的细胞工作,同时消除低表现不佳的细胞。该研究小组将一个传感器放置在细胞内,其可以感受到每一个细胞做了多少工作。如果传感器确定一个细胞正在制造很多的产品,传感器就会触发一个控制器,制造一种蛋白质,使细胞能够存活和成长。如果传感器检测到细胞工作不够努力,它就保持沉默,并且懒惰的细胞会因缺乏营养而死亡,或被抗生素破坏。

  研究小组将PopQC应用于两个大肠杆菌工程菌株:一个旨在产生游离脂肪酸——生物燃料或其他大容量化合物的前体;另一个菌株旨在产生酪氨酸——一种氨基酸,可能是药物的前体。张博士说,PopQC可让勤劳的细胞在两种培养物中占据主导地位,并导致游离脂肪酸和酪氨酸的总体产量提高了三倍。

  张博士说:“PopQC可适用于多种生物合成途径和宿主生物体,只要有合适的传感器存在,检测工程细菌中的产物。由于噪声是生物学中普遍存在的问题,所以这项工作的设计原则,应鼓励来自许多其他领域的工程师,提高该工程系统的效率。”

  在该大学技术管理办公室的援助下,张博士已就这一设计原则进行了ZL申请。张博士2003年在北京大学获得化学学士学位,之后在加拿大麦克马斯特大学获硕士学位,多伦多大学获博士学位,曾在劳伦斯伯克利国家实验室从事博士后研究,目前是圣路易斯华盛顿大学助理教授,他从2009年开始专注自然生物技术领域,发表过多项研究。张博士的研究兴趣集中于:应用合成生物学方法,来开发微生物系统,可持续地生产生物燃料、化学品和具有定义结构和可控性能的材料。他也感兴趣的是,开发某种工具,使工程微生物合成目标产品,并更有效和有力地执行复杂的任务。

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