固相萃取（SPE）或柱净化与色谱分析的在线结合目前主要有两种方式。一种是使用切换阀，将固相萃取柱和色谱分析柱连接，让色谱流动相把固相萃取柱上富集的样品全部转移到色谱分析柱（直接方式）。另一种是间接方式，采用和离线固相萃取一样的净化方式。样品组分收集后， 用萃取仪内置的进样器取10-20微升的组分注入色谱分析柱。直接方式的在线固相萃取具有灵敏度高和处理速度快的特点。直接方式的在线固相萃取要求萃取柱可以多次反复使用，因为连接在高压切换阀上的萃取柱不容易更换。 另外使用溶剂的性质要和色谱分析柱匹配 ，否则色谱峰变宽会影响分离效果。 由于这两条限制，采用的固相萃取柱一般只能是反相柱，而样品的成分要求比较干净。 目前这种方式主要是用于饮用水的分析。

使用间接方式的在线固相萃取， 可以不受上述两项条件的限制。供选择的固相萃取柱比较多，净化效果也比较好。 这种间接在线固相萃取的缺点是灵敏度比较低， 因为收集的组分只有一小部分用于色谱分析。 因此， 间接方式固相萃取比较适合样品成分比较复杂而灵敏度要求不太高的应用。

为了克服上述两种方式的局限， 加拿大博朗科技利用SPE-04的特有的功能，引进了二阶在线固相萃取。 它先采用间接方式的在线固相萃取作为第一阶段的样品净化， 组分经过溶剂修饰后再通过直接在线固相萃取进行富集。这种二阶在线固相萃取，先用第一阶固相萃取柱去除大部分样品的干扰物。所使用的萃取柱和普通的离线固相萃取一样， 可以是C18、 离子交换、 石墨化炭黑、亲和色谱等类型。第二阶固相萃取的作用是富集和进一步净化。因为样品已经比较干净， 第二阶固相萃取柱的寿命得以显著延长。