Illumina新款测序仪上市:NextSeq 500 & HiSeq X Ten
第32届摩根大通保健大会(JP Morgan Healthcare Conference)于1月13日在美国旧金山拉开帷幕。Illumina公司的CEO Jay Flatley在会议上宣布,Illumina将推出两款新的测序平台:NextSeq 500和HiSeq X Ten。NextSeq 500是一款新的台式高通量测序仪,大小与MiSeq相当,性能却与HiSeq相当;而HiSeq X Ten则包括10台HiSeq X测序仪,适合群体规模的测序项目。Flatley同时宣布,HiSeq X Ten首次让$1000的基因组测序成为现实。
NextSeq 500测序系统:
NextSeq 500系统集高通量测序的性能和台式测序仪的简约为一体,是目前唯一一款可实现外显子组、转录组和全基因组测序的台式测序仪。它可在两种模式下开展测序实验:高产量(High Output)和中等产量(Medium Output),在单次运行中可获得20-120 Gb的数据,为您带来广泛的应用灵活性。
与大家熟悉的MiSeq和HiSeq 2500相比,NextSeq 500的性能如何?
几款新型测序仪比较:NextSeq 500与MiSeq和HiSeq
HiSeq X Ten测序系统:
以Illumina成熟的边合成边测序技术为基础,HiSeq X Ten采用了多个先进的设计特点,以产生超高的通量。包含数十亿个纳米孔的流动槽,以及新的簇生成试剂让数据密度显著增加。利用最先进的光学设备和更快的试剂,HiSeq X Ten能够比以往更快地测序。每台HiSeq X仪器三天可产生1.8 Tb的数据,即每天600 Gb。若同时运行10台仪器,人们每年可测序>18,000个人类基因组。
$1000基因组测序的时代真的来了吗?
据Illumina介绍,HiSeq X Ten的上市让人类基因组的测序费用首次降至1000美元以下。之前,我们好像也听到过类似的千元基因组宣言,是不是早就实现了啊?千元基因组为什么这么重要?Illumina是否能真的实现千元基因组测序?这是不是意味着我们每个人都能随便测个基因组?让我们来看看Nature网站的解读。
Illumina测序平台的参数比较
MiSeq | NextSeq 500 | HiSeq 2500 | HiSeq X* | |||
关键应用 | 小型基因组、扩增子和靶向基因panel测序。 | 日常基因组、外显子组、转录组测序,及更多。 | 生产规模的基因组、外显子组、转录组测序,及更多。 | 群体规模的人类全基因组测序。 | ||
运行模式 | N/A | 高产量 | 中等产量 | 快速运行 | 高产量 | N/A |
每次运行处理的流动槽 | 1 | 1 | 1 | 1或2 | 1或2 | 1或2 |
产量范围 | 0.3-15 Gb | 20-39 Gb | 30-120 Gb | 10-180 Gb | 50-1000 Gb | 1.6-1.8 Tb |
运行时间 | 5-65小时 | 15-26小时 | 12-30小时 | 7-40小时 | <1天-6天 | <3天 |
每个流动槽的Reads† | 2500万‡ | 1.3亿 | 4亿 | 3亿 | 20亿 | 30亿 |
最长读长 | 2 x 300 bp | 2 x 150 bp | 2 x 150 bp | 2 x 150 bp | 2 x 125 bp | 2 x 150 bp |
* 表中显示单台HiSeq X系统的规格。HiSeq X只能作为HiSeq X Ten的一部分。
† 通过过滤的簇。
‡ 仅适用于MiSeq V3试剂盒。
注:数据来源于Illumina网站(http://www.illumina.com/systems/sequencing.ilmn)。数据有可能随时更新,请以Illumina网站为准。
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