专访Illumina高级副总裁：其它物种“工厂式”测序仪——Hiseq 3000/4000

近日，Illumina公司高级副总裁兼总经理Kirk Malloy接受采访表示：新发布的Hiseq 3000/4000平台将弥补Hiseq X ten只用于人类基因组测序的不足。

问 ：1月12日Illumina公司在JP摩根健康大会上公布Hiseq 3000/4000平台，你认为今年该平台在哪些方面会产生巨大影响呢？

答： Hiseq 3000/4000平台的发布让大多数人很兴奋，因为它可以进行各类物种的测序应用。去年，我们成功推出了Hiseq X ten测序平台。自那时起，大家就开始询问，什么时候能发布可用于其他物种的“工厂式”测序系统。如今，Hiseq 3000/4000恰好可以弥补Hiseq X ten只用于人类基因组测序的不足。

问：动植物基因组年会（PAG）刚举办结束，Illumina公司在农业市场上有何举措？

答：在动植物基因组（PAG）年会，以及上周的JP摩根健康大会上，大家确实对NextSeq 550的微阵列扫描技术很振奋。我们也正在考虑除了细胞遗传学及无创产前应用外，如何将微阵列扫描技术添加到其他仪器上。农林牧渔相关的研究人员期望能在系统上进行家畜和作物样本的扫描测序。微阵列扫描技术不仅能降低成本，还可以辅助基因分型。

去年我们也开发了几种芯片，比如玉米芯片；我们正在开发牛的芯片，目前大约有10多种合作产品。我们很关注牛基因组项目，之前牛的大部分基因组筛选与奶牛相关，现在有了种群全面的肉食牛特征的参考基因。我们相信此后会有很多相关研究。

问：作为Illumina公司生命科学业务部负责人，您对公司2015年有什么展望？

答：我们将推出一个全新的文库制备组合。在芯片业务方面，技术开发以及市场应用方面，争取进步。关键是开发新市场，驱动科技发展，其中包括大量的百万样本项目。我们将更新芯片产品，特别是在农业、生物资料库和甲基化方面。

本季度末，我们预计推出基于数字流体技术的NeoPrep系统，目前正在进行测试。我们即将推出的第一款试剂盒将能满足现有大约50%的文库需求，并且计划在未来一年内增加其他应用。这些试剂盒的一个重要优势是样本需求量的降低，每个孔大约10-15ng，比手工操作降低了80%。