2023年第一季度已经结束，又到了陈老湿交季报的时间。这个季度，国内使用Octet® 非标记分子互作系统发表文章越来越多，统计准确数量已经比较困难，初步预计在80篇以上；今天，陈老湿随机筛选了其中的50篇左右文章，为大家做了简要的分析与解读，以飨读者。
筛选条件
不包含预印版
不包含没有Octet® 数据的文章
须在国内使用Octet®
这50篇左右文章的单位和应用方向统计如下：
Octet® 文献统计
上海交通大学医学院 | 1 | 中科院武汉病毒研究所 | 2 |
华西医院 | 1 | 澳门科技大学 | 2 |
东北农业大学 | 1 | 烟台大学 | 1 |
重庆大学第二附属医院 | 1 | 大连海洋大学 | 1 |
中山大学 | 1 | 温州医科大学 | 2 |
广州医科大学八院 | 2 | 滨州医学院 | 1 |
山东中医药大学 | 1 | 巴斯德所 | 1 |
义翘神州 | 1 | 沈阳农业大学 | 2 |
上海生化所 | 1 | 昆明动物所 | 1 |
广州医科大学第一附属医院 | 1 | 四川大学 | 1 |
浙江大学 | 1 | 微生物所 | 1 |
中科院动物所 | 1 | 南京中医药大学 | 2 |
南京大学 | 2 | 南京农业大学 | 1 |
郑州大学 | 2 | 北京化工大学 | 1 |
山东大学 | 1 | 上海君实 | 1 |
清华大学 | 2 | 北京中日友好医院 | 1 |
第三军医大学 | 1 | 协和医学院 | 1 |
西湖大学 | 1 | 上海耳鼻喉医院 | 2 |
上海有机所 | 1 | ||
Octet® 应用方向
从以上图表可以看出：中科院武汉病毒研究所、南京大学、郑州大学等十几个单位发表的文章均在两篇以上。从应用方向上看，发表文章依然涉及到多个方向：其中小分子的应用文章超过蛋白和抗体应用的文章数量，占比超过1/3，牢牢占据榜首。高速增长的原因主要如下：生物层干涉（BLI）技术无流路、对溶剂（DMSO）不敏感、假阳性低、高通量、操作简单、成本低、仪器稳定性好，可以帮助研究人更快、更高质量的获得小分子检测的结果。
下面陈老湿挑选几篇代表性文章为大家一一解读：
最具影响力文章[1]
17S U2 被认为是直接参与早期pre-mRNA剪接体组装的人类 U2 snRNP 的功能复合物。17S U2 snRNP 的核心成分包括 SF3a、SF3b、12S U2 核心、剪接因子TAT-SF1 和DDX46。具有 RNA 伴侣活性的DDX42可能是在U2 snRNP 组装完成后释放的。西湖大学施一公及张晓峰团队报道了DDX42-SF3b 复合物的高分辨率结构，揭示了SF3b1 与DDX42、DDX46的结合位点，其中相互作用的7个SF3b1残基是癌症突变的靶点，包括最常见的突变残基 Lys700。因此，本研究的结果为SF3b1突变所致癌症的机制提供了新的见解。文章使用Octet® 证明了SF3b1 与DDX42、DDX46的高亲和力，验证了结构学分析的结果。
Octet® 亲和力实验：固化SF3b1与DDX42，DDX46进行结合解离，亲和力（KD值）在几十nM级别。
数据最丰富文章[2]
线粒体融合素（MFN1和MFN2）是介导线粒体融合和分裂的分子机器，均为发动蛋白（dynamin）超家族成员。MFN 家族的突变会导致腓骨肌萎缩症（CMT2A） 等多种遗传性神经退行性疾病。中国科学院动物研究所的科研团队发现从绣线菊提取的一种小分子天然产物的衍生物S89 具有促进线粒体融合的功效。S89 可以与GTP 酶竞争结合MFN1 的HB2 结构域，并解除MFN1 的自抑制，有效促进纯化MFN1 在体外的融合活性，并有助于线粒体相关疾病的治疗。该成果发表于Nature Chemical Biology 上。用Octet® 检测证明S89 直接结合于MFN1 第二个螺旋束（HB2）内的一个较松散区域。该文章的Octet® 小分子数据非常丰富。
Octet® RED96结果：将MFN1 不同结构域固化在SSA 传感器上，与S89 进行结合解离，发现S89 结合L1 结构域，与其他结构域不结合。
最具想象力文章[3]
GDF15 是青光眼的主要标志物，对其监测有助于青光眼风险筛查和早期诊断。复旦大学附属耳鼻喉医院高顺祥课题组获得了一种具有高亲和力的适配体（APT2TM），可以特异性的和高亲和力的与人来源的和大鼠来源的GDF15 结合。将酶联适配体夹心分析（ELASA）应用到基于生物层干涉技术（BLI）的Octet® 系统中，以开发一个自动化、高通量、实时监测的BLI-ELASA生物传感平台。Octet® 平台展示了宽泛的线性检测窗口（10–810 pg/mL）和高灵敏度（检测限为5–6 pg/mL）。证实了其在临床样品中应用于GDF15 定量时的优异性能。这项技术可以稳健、方便的用于青光眼风险筛查、早期诊断和动物模型评估。
Octet® 检测GDF15示意图，先将适配子固化在链霉亲和素传感器上，然后结合样品中的分析物，然后加入第二个偶联HRP 的适配子，用底物进行信号放大。
Octet® 分子互作分析系统的优势在于：
非标记Direct binding是趋势，结果更准确
快速测定亲和力，更加定量化地表征分子互作
无洗涤步骤，可测弱亲和力（解离快）
写入了美国药典，文章多，认可度广
万金油技术，可以用与检测DNA，小分子，蛋白质等各种生物分子
操作简便，耗材及维护成本低
最后，祝愿大家都可以用赛多利斯神器发出高分文章！
下载文档
《生物层干涉技术应用文集》
-参考文献-
[1] Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly.Nature Communications volume 14
[2] Small molecule agonist of mitochondrial fusion repairs mitochondrial dysfunction. Nature Chemical Biology,2023
[3] A novel biosensing platform for detection of glaucoma biomarker GDF15 via an integrated BLI-ELASA strategy
-END-
