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10x Genomics单细胞、单分子、转录组、VDJ服务

参考报价: 面议 型号: 10x Genomics
品牌: 10X genomics 产地: 其他国家
关注度: 24 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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ChromiumTM 系统一个系统,一套工作流程,强大的测序应用10x genomics公司推出了最新的ChromiumTM系统。利用上千万独特的DNA序列标记的GEMS,Chromium系统可揭示重要的基因组信息。

技术流程微反应体系(Partitioning)与DNA序列标记(barcode)

    1.将样本分配到100,000s到1000,000s微反应体系,每个微反应体系含有一种特定的DNA序列标记。

    2 含有barcode信息的凝胶珠子首先与样品和酶的混合物混合,然后与位于微流体"双十字"连接中的油表面活性剂溶液结合。

    3.GEMs 流到储液器中并进行收集。凝胶珠子溶解释放barcode序列,开始对样本进行标记。将每个液滴中含有barcode信息的产物混合。然后构建标准测序文库。

    三大应用ChromiumTM基因组人类基因组Resequencing可提供超长片段的全基因组信息,进行突变检出、单倍体分型和基因组结构鉴定。能够揭示遗传性疾病关键的变异,并发现与癌症相关的关键改变。

    新物种基因组的Denovo Assembly利用SupernovaTM Assembler系统可发现真实的基因组信息,并且成本低,质量高。不需要任何类型的参考序列,即可揭示样本特异性序列,研究二倍体基因组结构。

    技术原理1.通过低水平的酶促反应进行基因组扩增来添加barcode信息。

2.相同barcode的reads起源于同一个GEMS。


技术忧势

  

  1. 单个文库即可获得大量标记的油滴和完整的基因组信息(1ng input)

      2.揭开之前难以鉴定的基因组区域以及隐藏的关键基因突变

    3.将基因组分为多个兆碱基(Mbp)的单倍体连续区(phase blocks)

    4.进行兆碱基(Mbp)级别二倍体组装并不需要参考序列

    Chromium TM 单细胞 3’高通量单细胞RNA测序利用chromium Single Cell 3',在细胞水平进行高通量数字化基因表达谱分析,可对复杂细胞群进行深入分析。正确揭开复杂群体异质性的关键是能够分辨单个细胞。Chromium单细胞3'可进行1000至10000s个单细胞转录组分析技术原理1.mRNA逆转录产生带有barcode信息的cDNA2 通过barcode信息识别起源于单个细胞的转录物,然后计数。

    技术忧势1.有效的捕获每个细胞中成千上万的表达基因2.差异表达基因识别细胞周期3.包含单细胞的油滴多重态率较低





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