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工商注册信息已核实!参考报价: | 面议 | 型号: | OligoArray |
品牌: | CustomArray | 产地: | 江苏 |
关注度: | 25 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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全基因组外显子捕获和目标测序外显子捕获,是二代测序中的重要应用,这需要一次性合成几十至几百万条引物,OligoArray芯片式合成仪的出现解决了该问题,根据不同的配置,OligoArray可以一次性合成几万至几十万条引物OligoPOOL,几十万条引物在一个管中,这样,在二代测序时,就可以在有限容量的芯片中,进行有针对性的目标序列进行深度测序。得到质量更好的数据。
1. 应用背景
全基因组外显子捕获和目标测序外显子捕获,是二代测序中的重要应用,这需要一次性合成几十至几百万条引物,OligoArray芯片式合成仪的出现解决了该问题,根据不同的配置,OligoArray可以一次性合成几万至几十万条引物OligoPOOL,几十万条引物在一个管中,这样,在二代测序时,就可以在有限容量的芯片中,进行有针对性的目标序列进行深度测序。得到质量更好的数据。
2. OligoArray工作原理
将芯片放入合成仪中,合成仪控制芯片中每一个合成池的电极电位,在芯片上(一般为12000或者90000个合成池,即可同时合成12000或者90000个DNA的芯片),按照软件设计的DNA序列,合成一定长度的DNA,由待合成引物的3’端向5’端合成,相邻的核苷酸之间通过3'→5'磷酸二酯键连接,由此合成所需要的DNA/RNA。合成后的大量DNA从芯片上剪切下来,即单管中就会含有几万条引物,用于二代测序等工作。
3. OligoArray的主要功能及应用范围
· 高通量Oligo合成
· 基因合成
· 全基因组外显子捕获引物合成
· 小RNA合成
4. OligoArray技术参数:
· 在芯片上的原位式电化学Oligo合成。
· 可同时装载1~8张12k芯片(以8x12k配置为例)或者1~8张90k芯片(以8x90k配置为例),芯片规格:12K,90K。
· 单次最多合成8x90000个Oligo (以8x90k配置为例)
· 单次运行时间:小于48小时(以80mer Oligo为例)
· 合成规模:每个Oligo合成量约为1f Mol
· 6个标准Amidite接口,6个试剂瓶位
· 电化学去保护
5. OligoArray技术要求
一次合成最多8x90,000条Oligo(8x90k配置为例),或者8x12,000条Oligo(8x12k配置为例),48小时内即可完成,
平均每个合成循环的时间约为30分钟(每延伸一个碱基的反应为一个循环)
每个Oligo的合成规模在1f Mol左右(以80mer长度为例)
可合成最长达170mer的Oligo(长度越长,产率越低)。
8个合成池。
leave it on模式。
有6个单体瓶位和6个试剂瓶位
可使用非修饰单体或修饰单体和试剂进行合成
电化学方法去保护,采用选择性去保护方法,只将需要延伸的Oligo进行去保护反应,随后进行合成反应。
如选择Microarray配置,芯片可以在单色或者双色荧光Reader上进行扫描。
合成的Oligo可以Leave on chip 或者剪切下来做成Oligo Pool
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途