PRM靶向定量

• 服务简介

  PRM（平行反应监测，Parallel Reaction Monitoring）目前靶向蛋白质组学数据采集的主流方法，通过对特异性肽段或目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对或绝对定量。

  
  

• 技术原理

  PRM技术基于高分辨率、高精度质谱仪（如Q-Exactive HF-X等），首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力，选择性地检测目标肽段的母离子信息；随后在HCD碰撞池中碎裂；最后进入高分辨、高质量精度的Orbitrap分析器中，检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。

  

  
  

• 仪器设备

  Thermo Scientific Q Exactive HF-X

  Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos

  Thermo Scientific Q Exactive Plus

  Thermo Scientific Orbitrap Fusion

  Thermo Scientific Q Exactive

  
  

• 技术优势

  PRM结合了四级杆的高选择性以及Orbitrap的高分辨、高精度特性，优势在于：(1) 高分辨子离子监测，最大程度地排除了背景干扰；(2) 二级为全扫描，无需事先确定离子对和优化碰撞能量，只需要在数据处理时选择响应最高的一个或几个子离子，即可提取母子离子对的色谱峰进行定量，线性范围可达 5 ~ 6个数量级；(3) 同时定性与定量分析，二级全扫描谱图用于定性分析，选择其中最佳的子离子提取离子对即可完成定量分析。

  与传统蛋白质定量方法（Western/ELISA）相比

  

  
  

• 应用领域

  PRM具有精确的鉴定和定量能力，广泛应用于生命科学研究中。即可作为Label free、TMT、iTRAQ 和SILAC等高通量定量蛋白质组学数据的验证手段，也可用于目标蛋白的相对和绝对定量。

  
  

• 参考文献

  Xingye Xu，et al., 2018, The first whole-cell proteome- and lysine-acetylome-based comparison between Trichophyton rubrum conidial and mycelial stages，Journal of proteome reseach. 

  Benjamin B. Sun, et al.（2018）Genomic atlas of the human plasma proteome，Nature.  DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2.

  I-Hsuan Chen, et al. Phosphoproteins in extracellular vesicles as candidate markers for breast cancer, PNAS, 114, 3175 (2017).

  Petra, M. et al. Targeted proteomics analysis of protein degradation in plant signaling on an LTQ-Orbitrap mass spectrometer. Journal of proteome research 13, 4246 (2014).

  Florian Beck , et al., 2017, Temporal quantitative phosphoproteomics of ADP stimulation reveals novel central nodes in platelet activation and inhibition. Blood 2017 129:e1-e12.

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