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上海凌恩生物科技有限公司
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| 参考报价： | 面议 | 型号： | 基因组SSR开发 |
| 品牌： | 凌恩生物 | 产地： | 上海 |
| 关注度： | 9 | 信息完整度： |  |
| 样本： | 典型用户： | 暂无 |
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简单序列重复(Simple Sequence Repeats)，又名SSR是一类由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。SSR分子标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术。通过对样本基因组中SSR标记等DNA多态性的分析，可以得到样本DNA序列在遗传性状上的调控和差异，由于SSR标记在真核生物基因组中分布广，多态性丰富，具有很好的稳定性，通常为显性标记且符合孟德尔式遗传规律，信息量高等特点，因此被广泛应用于遗传图谱构建、目标基因标定，指纹图的绘制等研究中。
基于高通量测序技术，可针对全基因组范围进行SSR分子标记开发。
分析流程
分析示例
各类型SSR统计
SSR引物设计
ID | SSR nr. | SSR type | SSR | size | start | end | FORWARD PRIMER1 (5'-3') |
TRINITY_DN41187_c0_g1 | 1 | p2 | (CA)14 | 28 | 218 | 245 | CTCTGGCGTGTGCTTATTGC |
TRINITY_DN41152_c0_g1 | 1 | p1 | (A)12 | 12 | 615 | 626 | GCGGCTTCTCTAACACTGGA |
TRINITY_DN41133_c0_g1 | 1 | c | (AG)6g(A)14 | 27 | 330 | 356 | TTCTGGAAGATTGCCAGGGG |
…… |
Tm | REVERSE PRIMER1 (5'-3') | Tm | PRODUCT1 size (bp) | start (bp) | end (bp) |
59.902 | CTCAGGTTGATGAGCCACGT | 60.037 | 275 | 88 | 362 |
59.753 | TCTGTGTGTGCATGTTGACA | 57.964 | 238 | 484 | 721 |
59.667 | AGTGATGATTGGCAGTTTGGC | 59.453 | 232 | 180 | 411 |
…… |
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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途
