PRM靶向定量

PRM（平行反应监视，parallel reaction monitoring）是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。

技术原理

PRM技术基于高分辨、高精度质谱（如Orbitrap系列），首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力，在一级质谱中（Q1）选择性地检测目标肽段的母离子信息；随后在collision cell中对母离子进行碎裂；最后利用高分辨、高质量精度分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。

技术优势

• 质量精度达到ppm级，能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性，有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度；

• 对子离子进行全扫描，无需选择离子对和优化碎裂能量，更容易进行方法学建立；

• 更宽的线性范围：增加至5-6个数量级。

应用领域

• 验证定量蛋白质组学结果，验证翻译后修饰蛋白质组学结果；

• 目标蛋白质相对定量分析，目标蛋白质绝对定量分析；

• 诊断标志物靶向筛选；诊断标志物验证与绝对定量；验证基因表达产物。

样品要求

• 组织类型：动物组织≥100mg、植物组织≥100mg、微生物≥20mg；

• 细胞样品：每样品细胞量 ≥ 1X107

• 蛋白提取物：≥100µg

• 体液：血清/血浆≥200µL、尿液≥1ml、唾液/脑脊液≥1ml、泪液≥1mL、支气管灌洗液≥3ml；

• 外泌体：≥10µL

• FFPE石蜡包埋切片：≥0.3 mm * 0.3 mm

参考文献

[1]. Benjamin B. Sun, et al.（2018）Genomic atlas of the human plasma proteome，Nature. DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2.

[2]. Quantitative Profiling of Protein Tyrosine Kinases in Human Cancer Cell Lines by Multiplexed Parallel Reaction Monitoring Assays.  Mol Cell Proteomics. 2016 15(2):682-91.

[3]. Proteogenomic characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2014; 513(7518): 382-7.

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